SHIBA Kogiku

Affiliation
Institute of Life and Environmental Sciences
Official title
Assistant Professor
URL
Email
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Phone
0558-22-1317, 0558-22-6813
Research fields
Cell biology
Animal physiology/Animal behavior
Research keywords
sperm
flagella
cilia
sperm motility analysis
fertilization
motor protein
ascidian
sea urchin
Research projects
Elucidating the chemotactic response of sperm in a dioramic environment2021-09 -- 2026-03SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)115,180,000Yen
精子走化性における鞭毛運動制御機構の解明2020-09 -- 2021-07SHIBA KogikuNarishige Zoological Science Award/Research Grant600,000Yen
Regulation of sperm flagellar motility by Ca2+ and cAMP2019-04 -- 2022-03SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research (C)4,420,000Yen
Identification of regulatory factors for sperm flagellar motility by using proteomic analysis and molecular imaging techniques2016-04 -- 2019-03SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research (C)4,940,000Yen
Spatiotemporal visualization of intracellular calcium signal for regulation of sperm function2014-04 -- 2016-03SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists (B)4,030,000Yen
卵因子が制御する精子細胞内シグナルの可視化2010-04 -- 2012-03SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a Proposed Research Area)8,060,000Yen
Regulatory mechanism of flagellar and ciliary movement via calcium signaling2009 -- 2010SHIBA KogikuJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists (B)4,550,000Yen
Career history
2005-04 -- 2008-03University of TokyoMisaki Marine Biological StationPostdoctoral Fellow
2008-04 -- 2009-03University of TokyoMisaki Marine Biological StationPostdoctoral Fellow
2009-04 -- 2009-06University of TsukubaShimoda Marine Research CenterPostdoctoral Fellow
2009-07 -- (current)University of TsukubaShimoda Marine Research CenterAssistant Professor
Academic background
1996-04 -- 2000-03Ochanomizu University Faculty of Science Department of Biology
2000-04 -- 2005-03Ochanomizu University 人間文化研究科 人間環境科学専攻
Degree
2005-03博士(理学)Ochanomizu University
Academic societies
2018-03 -- (current)The Molecular Biology Society of Japan
2008 -- (current)THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
2001 -- (current)THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN
Honors & Awards
2018-12日本動物学会奨励賞
2017-02お茶の水女子大学賞：第1回 保井コノ賞
2016-06第18回守田科学研究奨励賞
2014-08Best Presentation Award
2010-0611th International Symposium on Spermatology,Best Poster Award
Articles
Books
  • Sperm guidance: comparison with motility regulation in bikont species.
    Shiba Kogiku
    Flagellar Mechanics and Sperm Guidance/Bentham Science Publishers/pp.349-389, 2015-11
  • Molecular comparison of the axonemal components between sperm flagella and Chlamydomonas flagella.
    Shiba Kogiku; Mizuno Katsutoshi; Inaba Kazuo
    Sperm Cell Research in the 21st Century: Historical Discoveries to New Horizons./Adthree Publishing Co. Ltd./pp.30-40, 2012-08
  • Modification of flagellar movement by sperm-activating　peptides in echinoderms
    柴 小菊
    2005-03
Conference, etc.
  • ピエゾ駆動対物レンズを用いたホヤ精子鞭毛運動の 3 次元的解析
    稲葉一男; 柴小菊
    第12回繊毛研究会/2022-10-30--2022-11-01
  • 3D 遊泳トラッキングシステムによるホヤ精子走化性の解析
    柴 小菊; 稲葉一男
    日本動物学会第93回早稲田大会2022/2022-09-08--2022-09-10
  • 精子走化性における遊泳方向制御機構の解析
    柴 小菊
    日本顕微鏡学会第78回学術講演会シンポジウム「受精・生殖研究の最前線」/2022-05-13
  • Regulatory mechanism for sperm chemotaxis and flagellar motility
    Shiba Kogiku
    INI-RIMS joint seminar/2023-10-26
  • 精子走化性の運動制御機構
    柴 小菊
    2023年度日本数理生物学会年会企画シンポジウムS3: Experiments and mathematics of morphogenesis and cell migration/2023-09-04
  • Exploring symbiotic cyanobacteria using size-fractionated environmental DNA samples.
    宮本知世; 矢吹彬憲; 野村真未; 柴小菊; 稲葉一男; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • 精子が卵に近づく運動メカニズム
    柴 小菊
    第45回エアロ・アクアバイオメカニズム学会講演会/2022-03-22
  • ジオラマ環境下での精子走化性の応答計測に向けて
    柴 小菊
    科学研究費助成事業 学術変革領域研究（A）「ジオラマ環境で覚醒する原生知能を定式化する細胞行動力学」 シンポジウム/2022-03-10
  • 3D 遊泳トラッキングシステムを用いたホヤ精子走化性の解析
    柴 小菊; 稲葉 一男
    2022 年生体運動研究合同班会議/2022-01-07--2022-01-09
  • The role of CNG channel in the regulation of flagellar motility in the ascidian sperm
    Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The virtual Dynein 2021 International Workshop/2021-09-08--2021-09-09
  • The role of CNG channel in the regulation of flagellar motility in the ascidian sperm
    柴 小菊; 稲葉 一男
    第92回日本動物学会オンライン米子大会/2021-09-02--2021-09-04
  • The role of Ca2+ in the regulation of flagellar movement during sperm chemotaxis
    Shiba Kogiku
    RIMS Workshop “Biofluid Mechanics of Reproduction” in Biofluids 2021/2021-07-29--2021-07-30
  • Change in the Helical Symmetry of Chlamydomonas and Ciona Flagellar Axonemes Coupled with the Change in Ca2+ Concentrations Revealed by X-ray Fiber Diffraction
    Oiwa Kazuhiro; Iwamoto Hiroyuki; Shiba Kogiku; Inaba ...
    64th Annual Meeting of the Biophysical-Society/2020-02-15--2020-02-19
  • Genome analysis of a symbiotic nitrogen-fixing cyanobaterium in a pelagic dinoflagellate, Histioneis depressa.
    Nakayama Takuro; Nomura Mami; Takano Yoshihito; Shiba Ko...
    VIII European Congress of Protistology/2019-07-28--2019-08-02
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    柴 小菊; 坂野 太一; 古田 寿昭; 藤原 英史; 馬場 昭次; 稲葉 一男
    第56回日本生物物理学会年会/2018-09-15--2018-09-17
  • Calaxin is essential for ciliary formation in nodal monocilia but not in sperm flagella or epithelial multicilia
    Kazuo Inaba; Kogiku Shiba; Natsuko Kawano Yuhkoh Satouh ...
    XIII International Symposium on Spermatology (ISS)/2018-05-09--2018-05-13
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    Kogiku Shiba; Taichi Sakano Toshiaki Furuta Eiji Fujiwa...
    XIII International Symposium on Spermatology (ISS)/2018-05-09--2018-05-13
  • Function of NCS family protein calaxin in the regulation of sperm flagellar waveform
    Mizuno Katsutoshi; Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan/2009-10-30--2009-11-01
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    Shiba Kogiku; Sakano Taichi; Furuta Toshiaki; Fujiwara E...
    International Workshop Dynein 2017/2017-10-29--2017-11-01
  • 精子走化性時の鞭毛波形制御におけるcAMPの役割
    柴 小菊; 坂野太一; 古田寿昭; 藤原英史; 馬場昭次; 稲葉一男
    生体運動研究合同班会議/2018-01-05--2018-01-07
  • 炭酸脱水酵素/CO2 を介したカレイ類系統特異的な精子運動阻害
    佐野 マリコ; 柴 小菊; 稲葉 一男
    日本動物学会第86回大会/2015-9-17--2015-9-19
  • A novel subunit of axonemal dynein contains a photoreceptor protein domain
    Kutomi Osamu; Keiko Hirose; Mizuno Katsutoshi; Shiba Kogi...
    17th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas/2016-06-26--2016-07-01
  • カルシウムイオンを介した精子鞭毛波形制御におけるcAMP の調整作用
    柴 小菊; 坂野 太一; 古田 寿昭; 藤原 英史; 馬場 昭次; 稲葉 一男
    日本動物学会第88回大会/2017-09-21--2017-09-23
  • Roles of calcium in the regulation of sperm flagellar movement
    Shiba Kogiku
    フランスビルフランシュ臨海実験所セミナー/2017-07-01
  • Roles of calcium in the regulation of sperm flagellar movement
    Shiba Kogiku
    第54回日本生物物理学会年会シンポジウム“運動性鞭毛・繊毛の最前線 －生体ナノマシンの制御機構－”/2016-11-25--2016-11-25
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Teaching
2024-10 -- 2024-10Marine Life and EnvironmentUniversity of Tsukuba.
2025-03 -- 2025-03Marine Molecular Biology IIUniversity of Tsukuba.
2024-04 -- 2024-08Methodology on Molecular and Cellular Biology IISUniversity of Tsukuba.
2024-04 -- 2024-08Thesis Research in Molecular and Cellular Biology SUniversity of Tsukuba.
2024-09 -- 2024-09Marine Course in Reproductive BiologyUniversity of Tsukuba.
2024-04 -- 2024-08Seminar on Molecular and Cellular Biology IISUniversity of Tsukuba.
2024-10 -- 2025-02Seminar on Molecular and Cellular Biology IFUniversity of Tsukuba.
2024-04 -- 2024-08Seminar on Molecular and Cellular Biology ISUniversity of Tsukuba.
2024-10 -- 2025-02Thesis Research in Molecular and Cellular Biology FUniversity of Tsukuba.
2024-10 -- 2024-12Marine Biology IIUniversity of Tsukuba.
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Other educational activities
2023-11 -- 2023-11非常勤講師明治大学農学研究科
2023-09 -- 2023-09非常勤講師瀬戸内 CN 国際共同研究センター
2017-04 -- 2018-03非常勤講師お茶の水女子大学理学部
2013-04 -- 2013-09非常勤講師山形大学理学部
2010-01 -- 2010-03非常勤講師お茶の水女子大学理学部
Talks
  • 海の中のミクロの世界ー鞭毛と繊毛
    柴 小菊
    下田臨海実験センター一般公開/2024-01-20
  • 海の中のミクロの世界 － 鞭毛と繊毛
    柴 小菊
    第11回女子中高生のための先端科学セミナー「海にいこうよ －サイエンスの宝庫へ－」/2021-05-16--2021-05-16
  • 海の中のミクロの世界－鞭毛と繊毛
    柴 小菊
    第7回リケジョ・未来シンポジウム/2017-09-17
  • カタユウレイボヤ精子走化性時における鞭毛運動調節機構
    柴 小菊; 馬場昭次; 吉田学
    第38回精子談話会/2007-01-13
  • カタユウレイボヤ精子走化性機構の解析.
    柴 小菊; 馬場昭次; 吉田学
    第21回エアロ・アクアバイオメカニズム研究会/2008-03-21
  • 海産無脊椎動物精子を用いた鞭毛運動制御機構の解析
    柴 小菊; 稲葉一男
    第63回日本細胞生物学会大会サテライトシンポジウム「繊毛研究のニューフロンティア －構造から機能そして病態へ－」/2011-06-29
  • 「海の中のミクロの世界～鞭毛と繊毛」
    柴 小菊
    動物学会（関東支部）企画ビデオ講演会： - 動画で見る海の生物の世界 -/2011-11-19
Professional activities
2020-09 -- 2022-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN理事
2018-09 -- 2020-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN関東支部委員
2015-03 -- 2021-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPANZDW(ZooDiversityWeb)委員会
2013-03 -- 2025-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN男女共同参画委員会
2012-10 -- 2013-09男女共同参画学協会連絡会第11期男女共同参画学協会連絡会運営委員
University Management
2010-04 -- 2021-03下田臨海実験センター運営委員
Other activities
2023-04 -- 2023-04科学技術週間イベント「筑波大学キッズ・ユニバーシティ」

(Last updated: 2024-11-28)