YOSHINO Ryunosuke

Affiliation
Institute of Medicine
Official title
Assistant Professor
Research keywords
Computational Chemistry, Molecular Simulation
Research projects
Development of linker design method for PROTAC based on ternary complex structure prediction2023-04 -- 2026-03YOSHINO RyunosukeJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Early-Career Scientists4,680,000Yen
Pharmacophore modeling using interaction analysis information by Fragment Molecular Orbital method2018-04 -- 2020-03YOSHINO RyunosukeJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists2,080,000Yen
Career history
2017-04 -- 2018-03Tokyo Institute of TechnologyEducation Academy of Computational Life SciencesSpecially Appointed Assistant Professor
Degree
2017-03Doctor of AgricultureGraduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo
Articles
Conference, etc.
  • AIと立体構造情報を活用したリード化合物提案システムの開発と適用
    工藤玄己; 中島 翔太; 市川 裕大; 平尾 巧; 吉野 龍ノ介; 上島 仁; 広川 貴次
    日本薬学会第145年会/2025-03-26--2025-03-29
  • Development of the Cryptic Site searching method with Mixed-solvent molecular dynamics and Topological data analyses methods
    Koseki J; Motono C; Yanagisawa K; Kudo G; Yoshino R; ...
    CBI学会2024年大会/2024-10-28--2024-10-31
  • Development of a molecular simulation method for evaluating PROTAC linkers via ternary complex prediction
    吉野 龍ノ介; 工藤 玄己; 平尾 巧; 広川 貴次
    日本薬学会第145年会/2025-03-26--2025-03-29
  • Cryptic site detection using machine learning based on mixed-solvent molecular dynamics simulations results
    C Motono; J Koseki; K Yanagisawa; G Kudo; R Yoshino; ...
    1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference/2024-10-22--2024-10-25
  • Development of the Cryptic Site searching method with Mixed-solvent molecular dynamics and Topological data analyses methods
    Koseki J; Motono C; Yanagisawa K; Kudo G; Yoshino R; ...
    1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference/2024-10-22--2024-10-25
  • Development of Structure- and AI-driven Lead Compound Generation System
    Kudo Genki; Nakajima Shota; Ichikawa Yudai; Hirao Tak...
    ACS Spring 2025/2025-03-23--2025-03-27
  • Structure-based Drug DesignにおけるAIを活用したリード化合物生成
    工藤 玄己; 中島 翔太; 市川 裕大; 平尾 巧; 吉野 龍ノ介; 上島 仁; 広川 貴次
    第41回メディシナルケミストリーシンポジウム/2024-11-20--2024-11-22
  • Automated Hit-to-Lead Optimization using the SINCHO protocol and ChemTS
    工藤玄己; 中島 翔太; 市川 裕大; 平尾 巧; 吉野 龍ノ介; 上島 仁; 広川 貴次
    CBI学会2024年大会/2024-10-28--2024-10-31
  • PROTAC-mediated ternary complex structure distribution profiles using enhanced sampling methods
    Kudo Genki; Hirao Takumi; Hirokawa Takatsugu; Yoshino ...
    IUPAB2024/2024-06-24--2024-06-28
  • タンパク質立体構造情報を利用した化合物生成AIによるHit-to-Lead
    工藤 玄己; 中島 翔太; 市川 裕大; 平尾 巧; 吉野 龍ノ介; 上島 仁; 広川 貴次
    第24回日本蛋白質科学会年会/2024-06-11--2024-06-13
  • バーチャルスクリーニングモデル作成のためのParallel Cascade Selection Molecular Dynamicsの応用
    平尾巧; 工藤玄己; 吉野龍ノ介; 広川 貴次
    第51回構造活性相関シンポジウム/2023-11-20
  • 拡張アンサンブル法を用いたPROTACリンカー設計のための三元複合体構造探索
    吉野龍ノ介; 工藤玄己; 平尾巧; 広川 貴次
    第51回構造活性相関シンポジウム/2023-11-20
  • Hit-to-Leadを指向した官能基修飾始点と伸長サイトの予測手法開発
    工藤玄己; 平尾巧; 吉野龍ノ介; 重田育照; 広川 貴次
    第 51 回構造活性相関シンポジウム/2023-11-20
  • Conformation Search of Ternary Complexes for Rational PROTAC Linker Design Using Enhanced Sampling Method
    吉野龍ノ介; 工藤玄己; 平尾巧; 広川 貴次
    CBI学会2023年大会/2023-10-25
  • Comprehensive Structural Analysis of PROTAC Mediated Ternary Complexes using Enhanced Conformational Sampling Methods
    工藤玄己; 平尾巧; 広川 貴次; 吉野龍ノ介
    CBI学会2023年大会/2023-10-24
  • Application of Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics for Generating Virtual Screening Models
    平尾巧; 工藤玄己; 吉野龍ノ介; 広川 貴次
    CBI学会2023年大会/2023-10-24
  • Hit-to-Lead最適化を目的とした立体構造に基づくリガンド伸長サイト予測
    工藤玄己; 平尾巧; 吉野龍ノ介; 重田育照; 広川 貴次
    第23回日本蛋白質科学会年会/2023-7-5
  • Molecular Dynamics for Visualization of Amino Acid Residue Interaction Profile of Molecular Probes
    Hirokawa Takatsugu; K Yanagisawa; R Yoshino; G Kudo
    日本生物物理学会第60回年会/2022-09-29
  • Amino acid preference mapping on protein-protein interaction surface using mixed-solvent molecular dynamics
    Hirokawa Takatsugu; G Kudo; K Yanagisawa; R Yoshino
    CBI学会2022年大会/2022-10-25
  • 蛋白質構造情報に基づく化合物結合サイト予測の高精度化
    広川 貴次; 工藤玄己; 吉野龍ノ介; 重田育照
    第 22 回日本蛋白質科学会年会/2022-06-07
  • インバース共溶媒分子動力学法による分子プローブ周辺残基環境の可視化
    広川 貴次; 柳澤渓甫; 吉野龍ノ介; 工藤玄己
    第 22 回日本蛋白質科学会年会/2022-06-08
  • DNAメチル基転移酵素阻害剤のアイソフォーム選択性の解明
    工藤 玄己; 重田 育照; 原田 隆平; 広川 貴次; 吉野 龍ノ介
    日本コンピュータ化学会2021年　秋季年会/2021/11/02--2021/11/03
  • Prediction of binding mechanism for DNA methyltransferase 3A selective inhibitor using molecular simulation approach
    Kudo Genki; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei; Hirokawa Ta...
    CBI学会2021年大会/2021/10/26--2021/10/28
  • 分子シミュレーション技術を用いたタンパク質－リガンド間の分子認識メカニズムの解析
    吉野 龍ノ介
    第43回日本分子生物学会年会/2020-12-02--2020-12-04
  • Structure-activity relationship analysis of mosquito glutathione S-transferase Noppera-bo and its inhibitors for insecticide development
    Inaba Kazue; Koiwai Kotaro; Ebihara Kana; Yoshino Ryunos...
    American Crystallographic Association (ACA) 2020 Virtual Meeting/2020-08-02--2020-08-07
  • more...

(Last updated: 2025-08-19)