KUME Keitaro

Affiliation
Institute of Medicine
Official title
Assistant Professor
Research fields
Parasitology (including sanitary zoology)
Life / Health / Medical informatics
Molecular biology
Research keywords
Artificial Intelligence
Mitochondrion-related organelles
Medical Database
Molecular evolution
Bioinformatics
Machine Learning
Research projects
真核生物における嫌気的ATP合成経路の多様性と進化2022-04 -- 2025-03HASHIMOTO TetsuoJapan Society for the Promotion of Science(JSPS)/Grant-in-Aid for Scientific Research(C)4,030,000Yen
Development of a deep learning model to predict diverse mitochondrial targeting signals in parasites2023-04 -- 2026-03KUME KeitaroJapan Society for the Promotion of Science(JSPS)/Grant-in-Aid for Early-Career Scientists4,680,000Yen
フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの機能進化の解明2019 -- 2023HASHIMOTO TetsuoJapan Society for the Promotion of Science/Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))18,330,000Yen
Developing a method for resolving bottleneck in analyses of national databases2019-08 -- 2021-03KUME KeitaroJapan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Research Activity Start-up2,860,000Yen
Academic background
2015-04 -- 2017-03筑波大学 システム情報工学研究科 コンピュータサイエンス専攻
2013-04 -- 2019-03筑波大学 生命環境科学研究科 生物科学専攻
Degree
2015-03修士（理学）University of Tsukuba
2017-03修士（工学）University of Tsukuba
2019-03博士（理学）University of Tsukuba
Academic societies
2013-08 -- (current)SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN
2013-12 -- (current)THE JAPANESE SOCIETY OF PARASITOLOGY
2016-07 -- (current)Information Processing Society of Japan
Articles
Conference, etc.
  • 寄生虫化に伴うディプロモナス類の遺伝子レパートリーの変化．
    久米 慶太郎; 若島 朋幸; 厳 翼; 岩本 亮介; 井上 貴史; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 稲垣...
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • Association between types of home healthcare and emergency house calls, hospitalization, and end of-life care: A nationwide study in Japan
    孫 瑜; 岩上　将夫; 小宮山　潤; 杉山　雄大; 井口 竜太; 佐方　信夫; 伊藤　智子; 吉江　悟; 松井...
    WONCA Sydney World Conference/2023-10-26--2023-10-29
  • Toward a Patient-Centered Care Supporting System: Integration of Multidisciplinary Health Records in Breast Cancer Care
    Sugiyama Atsuko; Utsunomiya Kazuki; Okumiya Hayato; Fu...
    34th Medical Informatics Europe Conference (MIE2024)/2024-08-25--2024-08-29
  • Giardia intestinalis とその自由生活性近縁種におけるAcetyl-CoA Synthetase (ACS) の比較解析
    小金丸 利隆; 田村 嘉孝; 星 康貴; 久米 慶太郎; 橋本 哲男; 奈良 武司
    The 93rd Annual Meeting of the Japanese Society of Parasitology/2024-03-09--2024-03-10
  • Transition of the gene repertoire with adaptation to parasitic lifestyle in Diplomonads: orthology analysis with related free-living species
    久米 慶太郎; 若島 朋幸; 厳 翼; 岩本 亮介; 井上 貴史; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 稲垣...
    The 93rd Annual Meeting of the Japanese Society of Parasitology/2024-03-09--2024-03-10
  • AtLASS: A Scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM.
    原田亮; 久米慶太郎; 堀江和正; 中山卓郎; 稲垣 祐司; 天笠俊之
    第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会/2023-06-29--2023-07-01
  • 全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防効果の検討
    孫 瑜; 岩上将夫; 小宮山潤; 杉山雄大; 井口竜太; 佐方信夫; 伊藤智子; 吉江悟; 讃岐勝; 久米慶太郎; 松居宏樹; 植嶋大...
    第81回日本公衆衛生学会総会/2022-10-07--2022-10-09
  • Search for free-living-related proteins in free-living diplomonads that transitioned from a parasitic ancestor
    厳翼; 久米慶太郎; 阿部一貴; 矢﨑裕規; 小松崎洋志; 谷藤吾朗; 神川龍馬; 稲垣 祐司; 橋本哲男
    第92回寄生虫学会大会/2023/03/30--2023/03/31
  • 全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防
    孫瑜; 岩上　将夫; 小宮山潤; 杉山 雄大; 井口　竜太; 佐方信夫; 伊藤智子; 吉江悟; 讃岐勝; 久米慶太郎; 松居宏樹; 植...
    第81回日本公衆衛生学会/2022-10-7--2022-10-9
  • Microheriella maris units Archaeplastida and Cryptista in phylogenomics.
    Euki Yazaki; Akinori Yabuki; Ayaka Imaizumi; Keitaro Kum...
    Asian Congress of Protistology IV/2021-11-19--2021-11-21
  • エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム．
    矢吹彬憲; 矢﨑裕規; 今泉彩香; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 稲垣 祐司
    日本藻類学会第44回大会/2020-03-26--2020-03-28
  • 有孔虫Ammonia beccariiのミトコンドリアに局在するDNA分子群．
    石谷佳之; 久米慶太郎; 稲垣 祐司
    第3回日本共生生物学会/2019-11-19--2019-11-20
  • フィロジェノミック解析により推測されたMicroheliella marisの系統的位置．
    矢﨑裕規; 今泉彩香; 久米慶太郎; 白鳥峻志; 橋本哲男; 矢吹彬憲; 石田健一郎; 稲垣 祐司
    第3回日本共生学会大会/2019-11-19--2019-11-20
  • Mitochondrial genome of strain SRT308: insights into structure and gene content fo the ancestral euglenozoan mitochondrial genome.
    Yazaki Euki; Shiratori Takashi; Kume Keitaro; Hashimoto ...
    ISEP XXII/2018-05-27--2018-06-01
  • ユーグレノゾア基部から分岐する新奇原生生物のミトコンドリアゲノム.
    矢崎裕規; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; Inagaki Yuji
    第50回日本原生生物学会・第1回日本共生生物学会合同大会/2017-11-17--2017-11-19
  • A heterolobosean strain SRT213 and its mitochondrion-related organelle.
    Yazaki Euki; Shiratori Takashi; Kume Keitaro; Hashimoto ...
    ICOP2017/2017-07-31--2017-08-04
  • 機械学習を用いた非モデル生物におけるミトコンドリア及び関連オルガネラタンパク質の予測手法
    久米慶太郎; 天笠俊之; 橋本 哲男; 北川 博之
    情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会/2016-06
  • The draft genome of Kipferlia bialata reveals that the gain of function contributes the massive reductive evolution in Metamonada.
    Goro Tanifuji; Sun Takabayashi; Keitaro Kume; Mizue Taka...
    Protis-2016 Moscow Forum/2016-06-06--2016-06-10
  • フォルニカータ生物群の基部から分岐する新奇嫌気性生物PAP020株のミトコンドリア様オルガネラの代謝機能の推測
    矢崎裕規; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; 稲垣 祐司
    第85回日本寄生虫学会/2016-03-19--2016-03-20
  • Prediction and comparison of the metabolism of mitochondrion-related organelles in free-living fornicate organisms.
    Keitaro Kume; Shun Takabayashi; Ryoma Kamikawa; Goro Tan...
    2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells/2015-09-30--2015-10-02
  • トランスクリプトームデータを基盤とした大規模分子系統解析による新奇嫌気性真核微生物PAP020株の系統的位置の解明
    矢崎裕規; 白鳥隆志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; 稲垣 祐司
    日本進化学会第17回大会/2015-08-20--2015-08-21
  • Strain PAP020, a novel anaerobic microeukaryote branching at the base of Fornicata.
    Euki Yazaki; Takashi Shiratori; Keitaro Kume; Sohta A Is...
    VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015/2015-09-05--2015-09-10
  • Is a microaerophilic flagellate strain PAP020 is the most basal member of the Fornicata?
    Euki Yazaki; Takashi Shiratori; Keitaro Kume; Sohta A Is...
    Annual Meeting of Canadian Institute for Advanced Research, Integrated Microbial Biodiversity Program/2015-05-27--2015-05-29
  • Genome and transcriptome analyses of the Fornicata organism, Kipferlia bialata, based on the establishment of monoxenic culture.
    高林舜; 谷藤吾朗; 久米慶太郎; 稲垣 祐司; 橋本哲男
    第84回日本寄生虫学会大会/2015-03-21--2015-03-22
  • キネトプラスチダ類における寄生性鞭毛虫の系統的位置と寄生性形質獲得プロセスの解明
    矢﨑裕規; 石川奏太; 久米慶太郎; 谷藤吾朗; 橋本哲男; 稲垣 祐司
    日本進化学会第16回大会/2014-08-21--2014-08-24
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Teaching
2022-07 -- 2022-07Frontier Informatics AUniversity of Tsukuba.
2021-07 -- 2021-07Frontier Informatics AUniversity of Tsukuba.
2020-07 -- 2020-07フロンティアインフォマティクス特論A筑波大学

(Last updated: 2024-10-09)