Tsuchiya Takaho

Affiliation
Institute of Medicine
Official title
Assistant Professor
ORCID
0000-0001-7540-5115
KAKEN ID
70853167
URL
Email
G-x$x!(E-,.z!"2x<KG&{E-,.$.yxExzE#)
Office
Bioinformatics Laboratory
Research fields
Life / Health / Medical informatics
System genome science
Research keywords
情報生命科学
Systems Biology
Bioinformatics
Research projects
2型糖尿病の代謝アダプテーション2020-04 -- 2022-03黒田真也Japan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas4,937,182Yen
1細胞空間トランスクリプトームによる細胞内と細胞間の統合ネットワーク推定手法開発2020-04 -- 2023-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists4,160,000Yen
集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計法の確立2019-08 -- 2021-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Research Activity start-up2,860,000Yen
集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計手法の確立2019-08 -- 2020-03Takaho TsuchiyaUniversity of Tsukuba/Tsukuba Basic Research Support Program Type S1,000,000Yen
シグナル伝達の時間パターンから解明するリガンド選択的な遺伝子発現機構2014-04 -- 2017-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for JSPS Fellows3,200,000Yen
Career history
2019-05 -- (current)University of TsukubaCenter for Artificial Intelligence Research
2019-05 -- (current)University of Tsukuba医学医療系 生命医科学域 バイオインフォマティクス研究室Assistant Professor
2017-04 -- 2019-03Astellas Pharma Inc.Associate
2014-04 -- 2017-03Japan Society for the Promotion of ScienceResearch Fellow (DC1)
Academic background
2014-04 -- 2017-03University of Tokyo Faculty of Science Department of Biological Sciences
2012-04 -- 2014-03University of Tokyo Faculty of Science Department of Biophysics & Biochemistry
2007-04 -- 2012-03Kyoto University Faculty of Science
Degree
2018-03Ph.D.The University of Tokyo
Licenses and qualifications
2014-08東京大学Future Faculty Program（Faculty Development）修了
Academic societies
-- (current)THE JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS
Honors & Awards
2021-09第10回 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）Poster Award
2020-09第9回 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）Poster Award
2014-0915th International Conference on Systems Biology Student Bursary Award
Articles
Conference, etc.
  • Predicting SNPs' effects on transcriptional factor binding and cell-type specificity using a crowd of ChIP-seq data
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 松本 拡高; 尾崎 遼
    日本人類遺伝学会第67回大会/2022-12-14--2022-12-17
  • MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース
    田原沙絵子; 土屋 貴穂; 松澤 亮輔; 尾崎遼
    トーゴーの日シンポジウム/2022-09-28--2022-10-05
  • MOCCSプロファイルで明らかにする、転写因子認識配列の細胞型特異性とヒト一塩基多型が 転写因子結合へ与える影響
    田原沙絵子; 土屋 貴穂; 松本拡高; 尾崎遼
    2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022)/2022-09-13--2022-09-15
  • CCPLS reveals cell-type specific spatial dependence of transcriptome in single cells
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    CREST BioDX Symposium 2021/2021-11-21--2021-11-22
  • Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cells
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）/2021-9-27--2021-9-29
  • k-mer profile analysis clarifies cell-type specific TF binding landscape in human
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会（IBMP2021）/2021-09-27--2021-09-29
  • ChIP-Atlasの二次解析による多彩な転写因子認識配列の解明および更なるデータベース化
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    トーゴーの日 シンポジウム 2020/2020-10-06--2020-10-06
  • 機械学習を用いたRNA安定性予測モデルの開発
    服部 恵美; 土屋 貴穂; 脇田 寛泰; 川田 健太郎; 山地 雄大; 和田 洋一郎; 秋光 信佳; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03
  • CellCellTopic： cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03
  • Large-scale analysis of ChIP-seq database “reveals cell type specific TF binding k-mer
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）/2020-09-01--2020-09-03
  • System Identification of Signaling Dependent Gene Expression with Different Time-Scale Data
    土屋 貴穂
    Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Seminar Series of Cell Fate Dynamics & Therapeutics/2020-03-23
  • シングルセル空間トランスクリプトームデータを用いた遺伝子制御ネットワークの空間分布解析
    土屋 貴穂; 尾崎遼
    第8回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2019）/2019-09-09--2019-09-11
  • 医薬学で応用問題を解くためのバイオインフォマティクス
    土屋 貴穂
    筑波大学 医学医療系 生命医科学域平成30年度公開講演会/2019-02-18
  • 創薬研究におけるデータサイエンス
    土屋 貴穂; 和田 卓也
    特定非営利活動法人 医学統計研究会 特定主題シンポジウム2018 ｢製薬企業におけるデータ・サイエンティストの役割｣/2018-02-03
  • Time-Series Data-Driven Modeling approach for Temporal Decoding of Cellular Signal Transduction in differentiation of PC12 cells
    Tsuchiya Takaho; Kudo Takamasa; Uda Shinsuke; Wada Takum...
    ICSB 2014 - 15th International Conference on Systems Biology/2014-09-14--2014-09-18
  • Fully Automated Technique for Cellular Signaling Analysis with High Temporal Resolution
    Tsuchiya Takaho; Takamasa Kudo; Yasunori Komori; Kuroda ...
    International Workshop on Quantitative Biology/2012-12--2012-12
  • Fully Automated Technique for Cellular Signaling Analysis with High Temporal Resolution
    Tsuchiya Takaho; Kudo Takamasa; Komori Yasunori; Kuroda ...
    6th AYRCOB/2012-12--2012-12
Teaching
2023-07 -- 2023-08BioinfomaticsUniversity of Tsukuba.
2022-07 -- 2022-08BioinfomaticsUniversity of Tsukuba.
2021-07 -- 2021-08BioinfomaticsUniversity of Tsukuba.
Other educational activities
2019-07 -- 2019-092019年度 第1-2回 人工知能スキル研修（7月・9月）
Other activities
2012 -- 20162012年度 - 2016年度 東京大学 理学部 生物化学実験I プログラミングパート ティーチングアシスタント
2020-04 -- (current)ヒューマニクス学位プログラム 授業担当教員

(Last updated: 2024-04-10)