HARADA Ryuhei

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Conference, etc.
  • ペプチドの膜透過性を評価する分子シミュレーション技術の創出
    原田 隆平
    CBI学会(情報計算化学生物学会)2021年度大会 フォーカストセッション「ペプチド創薬を指向した計算科学の最前線」/2021-10
  • タンパク質二次構造の網羅的予測
    森田 陸離; 原田 隆平; 重田 育照
    第21回日本蛋白質科学会年会/2021-06
  • 統計モデルを用いた天然変性領域の特徴抽出のための新たなスコア
    會田 勇斗; 原田 隆平; 重田 育照; 富井 健太郎
    第21回日本蛋白質科学会年会/2021-06
  • 分子動力学計算で解明する維持メチル化酵素 DNMT1の活性化メカニズム
    保田 拓範; 森田 陸離; 重田 育照; 原田 隆平
    第21回日本蛋白質科学会年会/2021-06
  • 分子動力学計算で解明する維持メチル化酵素 DNMT1の活性化メカニズム
    保田 拓範; 森田 陸離; 重田 育照; 原田 隆平
    第21回 日本蛋白質科学会 年会
  • Prediction of binding mechanism for DNA methyltransferase 3A selective inhibitor using molecular simulation approach
    Kudo Genki; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei; Hirokawa Ta...
    CBI学会2021年大会/2021/10/26--2021/10/28
  • Comprehensive Analysis of Intrinsically Disordered Regions to Elucidate Their Physical Properties using a Modified Parameter
    Aida Hayato; Harada Ryuhei; Yasuteru Shigeta; Tomii Kentaro
    The 64th Anneal Meeting of the Biophysical Society/2021-02
  • マルチウォーカーの再配置に基づく効率的なタンパク質構造サンプリング法の開発
    保田 拓範; 重田 育照; 原田 隆平
    第34回 分子シミュレーション討論会/2020-12
  • ld-PaCS-MD : PaCS-MDに基づくタンパク質−リガンド結合経路探索
    會田 勇斗; 重田 育照; 原田 隆平
    第34回 分子シミュレーション討論会/2020-12
  • モーフィングを利用してタンパク質の構造遷移を効率よく評価する
    森田 陸離; 重田 育照; 原田 隆平
    第34回 分子シミュレーション討論会/2020-12
  • PaCS-MDと異常検知を援用したレアイベントサンプリング法の開発
    原田 隆平; 山口 孝太; 重田 育照
    第34回 分子シミュレーション討論会/2020-12
  • A Development of Ligand Docking Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (ld-PaCS MD) and its Applications
    Aida Hayato; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei
    第58回日本生物物理学会年会/2020-09
  • Theoretical Analyses on Dynamic Properties of DNA methyltransferase 1 and its Cofactors Based on All-atom Molecular Dynamics Simulations
    Yasuda Takunori; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei
    第58回日本生物物理学会年会/2020-09
  • Development of de novo Method for Searching Protein-Ligands Binding Pathway: Ligand-Docking Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (ld-PaCS-MD)
    Aida Hayato; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei
    2020 World Conference on Protein Science/2020-07
  • The Analyses of Dynamic Properties of Dnmt1 and Cofactors Based on All-atom Molecular Dynamics Simulations
    Yasuda Takunori; Shigeta Yasuteru; Harada Ryuhei
    2020 World Conference on Protein Science/2020-07
  • 環状ペプチドにおける、溶媒の違いによる構造変化と自由エネルギー安定性の評価
    柳 昂輝; 重田 育照; 西澤 宏晃; 原田 隆平; 吉野 龍ノ介; 満田 祐樹
    日本コンピュータ化学会2019秋季年会/2019-10-24--2019-10-25
  • Systematic trends and features in the stable structure of cyclic dipeptides
    栁 昂輝; 西澤 宏晃; 吉野 龍ノ介; 原田 隆平; 重田 育照
    第57回日本生物物理学会年会/2019-09-24--2019-09-26
  • 分散型シミュレーションに基づくレアイベントサンプリング法の開発
    原田 隆平
    化学反応のポテンシャル曲面とダイナミックス/2020-03-26
  • 新しい機能分子設計を目指した分子シミュレーション手法の開発
    原田 隆平
    第100回日本化学会春季年会「特別企画」分子のレジデンスを考える−新しい機能分子設計の鍵として−/2020-03-22
  • タンパク質の機能発現に重要なレアイベ ントを抽出するサンプリング手法の開発 (2019年度 分子シミュレーション学会 学術賞 受賞講演)
    原田 隆平
    第33回分子シミュレーション討論会/2019-12-10--2019-12-10
  • 中分子環状ペプチドの膜透過性を評価する分子シミュレーション手法の開発
    原田 隆平
    筑波大学計算科学研究センター 計算メディカルサイエンス事業部発足キックオフシンポジウム/2019-12-06--2019-12-06
  • カスケード選択型分子動力学シミュレーションで実現する環状ペプチドの膜透過シミュレーション
    原田 隆平
    東京大学 情報基盤センター H31 インターン・前期「若手・女性利用者推薦」成果報告会/2019-12-03--2019-12-03
  • レアイベントサンプリング法の開発と応用研究
    原田 隆平; Sladek Vladimir; 重田育照
    日本コンピュータ化学会2019年秋季年会/2019-10-24--2019-10-24
  • 生体機能を解明する分子シミュレーション手法の開発と応用
    原田 隆平
    筑波大学 プレ戦略研究会「生命から学ぶ」/2019-10-10--2019-10-10
  • in slicoタンパク質設計を実現する分子シミュレーション手法の構築
    原田 隆平
    生物工学会シンポジウム"in silicoタンパク質設計で加速するタンパク質工学・応用構造生物学"/2019-09-18--2019-09-18
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