OHNO Satoshi

Affiliation
Life Science Center for Survival Dynamics, Tsukuba Advanced Research Alliance (TARA)
Official title
Associate Professor
ORCID
0000-0002-5642-8167
Sex
Male
URL
Office
Computational Systems Biology
Research keywords
Systems Biology
Systems Medicine
Bioinformatics
Metabolic Engineering
Research projects
深層学習によるヒト全身代謝と臓器間相互作用の解明2024-04 -- 2028-03大野聡日本学術振興会/科学研究費助成事業18,590,000Yen
炎症性腸疾患における免疫代謝と細胞間相互作用の解明2024-03 -- 2025-04大野聡公益財団法人 上原記念生命科学財団/2023年度 研究奨励金2,000,000Yen
肥満に伴う代謝制御システム異常の解明に向けたマルチオミクス統合AIの開発2023 -- 2028大野聡公益財団法人 武田科学振興財団/2023年度 医学系研究助成2,000,000Yen
Inter-organ metabolic flux analysis for glucose-administrated mice2021-04 -- 2025-03大野 聡Japan Society for the Promotion of Science/Grants-in-Aid for Scientific Research4,680,000Yen
Metabolic flux analysis for the liver of mice administered with glucose2017-04 -- 2020-03Ohno SatoshiJapan Society for the Promotion of Science/Grants-in-Aid for Scientific Research2,600,000Yen
Career history
2015-04 -- 2016-03The University of TokyoGraduate School of ScienceProject Research Associate
2016-04 -- 2019-03The University of TokyoGraduate School of ScienceProject Assistant Professor
2019-04 -- 2022-12The University of TokyoGraduate School of ScienceAssistant Professor
2023-01 -- 2025-12Institute of Science TokyoInstitute of Integrated Research, M&D Data Science CenterJunior Associate Professor
2026-01 -- (current)University of TsukubaLife Science Center for Survival Dynamics, Tsukuba Advanced Research AllianceAssociate Professor
Academic background
2005-04 -- 2010-03Osaka University School of Engineering Division of Applied Science
2010-04 -- 2012-03Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
2012-04 -- 2015-03Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
Degree
Ph.D. in Information ScienceOsaka University
Academic societies
2026-06 -- (current)THE JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS
2024-05 -- (current)日本分子生物学会
Honors & Awards
2026-08優秀ポスター発表賞Deep learning-based single-cell metabolic flux inference
2019ポスター演題最優秀賞インスリン刺激下の脂肪細胞の代謝フラックスおよびその調節の数理解析
2014第22回生物工学論文賞In silico screening of triple reaction knockout Escherichia coli strains for overproduction of useful metabolites
2012Student/Young Investigator Poster Award, Topical Area: System biology and Metabolic engineering.Student/Young Investigator Poster Award, Topical Area: System biology and Metabolic engineering.
Articles
Books
  • 大腸菌による有用物質生産に向けた3重反応破壊のin;silicoスクリーニング
    大野 聡
    生物工学会誌/日本生物工学会, 2015
  • インスリン刺激の時間パターンおよび濃度による選択的遺伝子発現制御
    大野 聡
    Japanese Scientists in Science Signaling 2016/コスモ・バイオ株式会社, 2016
  • 脂肪細胞におけるインスリン依存性糖代謝の速度論的トランスオミクス解析
    門脇 孝; 山内 敏正; 大野 聡
    糖尿病学/診断と治療社, 2021-05
  • 代謝フラックスの定量によるトランスオミクスネットワークの理解
    大野 聡
    生物工学会誌/日本生物工学会, 2022
  • 第3章 1. 2型糖尿病の理解に向けたトランスオミクス解析
    大野 聡; 黒田 真也
    マルチオミクス データ駆動時代の疾患研究/羊土社, 2023-09
  • 第4章 1. 2型糖尿病に伴う糖代謝変化と制御のマルチオミクス解析
    大野 聡; 黒田 真也
    実験デザインからわかるマルチオミクス研究実践テキスト : 実験・解析・応用まで現場で使えるプログラムコード付き完全ガイド/羊土社/p.235 - 242, 2025-04
Conference, etc.
  • 大腸菌のゲノムスケール代謝モデルによる有用物質生産位向けた代謝予測
    大野 聡; 古澤 力; 田中 章太郎; 平沢 敬; 清水 浩
    生物工学会第62回大会/2010-10-27
  • 代謝シミュレーションを用いた有用物質生産性を向上させる複数遺伝子破壊の予測アルゴリズム開発
    大野 聡; 古澤 力; 清水 浩
    生物工学会第63回大会/2011-09-26
  • FastPros: Screening method of multiple gene knockout for microbial production using genome-scale metabolic model
    Ohno Satoshi; Furusawa Chikara; Shimizu Hiroshi
    Metabolic Engineering IX/2012-06-04
  • FastPros: Efficient screening algorithm of gene knockouts for useful compound production using genome-scale metabolic model
    Ohno Satoshi; Furusawa Chikara; Shimizu Hiroshi
    KAIST-OSAKA U Symposium 2012/2012-08-10
  • FastPros: 有用物質生産性向上に向けた多重遺伝子破壊のin silico スクリーニング
    大野 聡; 古澤 力; 清水 浩
    生物工学会第64回大会/2012-10-23
  • 大腸菌によるグリセロールからの3-ヒドロキシプロピオン酸生産
    徳山 健斗; 田中 章太郎; 大野 聡; 吉川 勝徳; 古澤 力; 清水 浩
    日本農芸化学会2013年度大会/2013-03-24
  • in silicoスクリーニングにより代謝物質生産が予測された大腸菌多重遺伝子破壊株の特徴解析
    大野 聡; 古澤 力; 清水 浩
    生物工学会第65回大会/2013-09-14
  • 代謝シミュレーションを用いた、微生物によるものづくりのための多重遺伝子破壊探索手法の開発
    大野 聡
    八大学博士学生交流フォーラム第5回研究会/2013-11-08
  • 代謝シミュレーションを用いた、微生物によるものづくりのための多重遺伝子破壊探索手法の開発
    大野 聡; 古澤 力; 清水 浩
    生命情報科学若手の会 第5回研究会/2014-02-18
  • Increased 3-hydroxypropionic acid production from glycerol based on the genome-scale metabolic simulation in Escherichia coli
    Tokuyama Kento; Ohno Satoshi; Yoshikawa Katsunori; Hir...
    Metabolic Engineering X/2014-06-16
  • 微生物育種に向けた多重遺伝子破壊のin silicoスクリーニング
    大野 聡; 古澤 力; 清水 浩
    生物工学若手研究者の集い（若手会）夏のセミナー2014/2014-07-12--2014-07-13
  • 代謝予測に基づいた3HP高生産大腸菌の構築
    徳山 健斗; 大野 聡; 吉川 勝徳; 古澤 力; 清水 浩
    日本農芸化学会2014年度大会/2015-03-27
  • Metabolic flux analysis in insulin-stimulated adipocytes form temporal patterns of intracellular metabolome data
    Ohno Satoshi; Krycer James; Yugi Katsuyuki; Quek Lake...
    Metabolic Engineering XI/2016-06-27
  • 代謝システムの理解と応用に向けた数理解析
    大野 聡
    日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 第一回勉強会/2017-08-10
  • 13C-based dynamic metabolic flux analysis in insulin-stimulated adipocyte cell lines and systematic evaluation of regulation on the metabolism,
    Ohno Satoshi; Quek Lake-Ee; R. Krycer James; Yugi Kat...
    Metabolic Engineering 12/2018-06-25
  • インスリン刺激下の脂肪細胞の代謝フラックスおよびその調節の数理解析
    大野 聡; 黒田 真也
    第四回生活習慣病とがんの代謝栄養メカニズム研究会/2019-03-19
  • Regulation of metabolic fluxes in adipocytes with insulin
    大野 聡; 平山 明由; 曽我 朋義; James David; 黒田 真也
    第13回メタボロームシンポジウム/2019-10-18
  • Metabolic flux changes over time and the regulatory mechanisms in insulin-stimulated adipocytes
    Ohno Satoshi; Quek Lake-Ee; R. Krycer James; Yugi Kat...
    The 20th International Conference on Systems Biology (ICSB 2019)/2019-11-02
  • インスリン刺激下の脂肪細胞における速度論的トランスオミクス解析
    大野 聡; 黒田 真也
    第51回化学工学会秋季大会/2020-09-26
  • 脂肪細胞におけるインスリン依存性糖代謝の速度論的トランスオミクス解析
    大野 聡
    質量インフォマティクス研究会 2021年ワークショップ/2021-06-10
  • 脂肪細胞におけるインスリン依存性糖代謝の速度論的トランスオミクス解析
    大野 聡; 黒田 真也
    日本プロテオーム学会 2021年大会/2021-07-21
  • Omics-based label-free metabolic flux inference reveals dysregulation of glucose metabolism in liver associated with obesity
    植松 沙織; 大野 聡; 黒田 真也
    2021年日本バイオインフォマティクス学会・第10回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2021)/2021-09-27
  • 少数の酵素に対するインスリン依存性リン酸化とアロステリック制御による脂肪細胞の糖代謝制御
    大野 聡; 黒田 真也
    第45回日本分子生物学会/2022-12-02
  • OMELET: Multi-omics-based metabolic flux inference for understanding obesity-associated dysregulatory mechanisms in liver glucose metabolism.
    Ohno Satoshi; Uematsu Saori; Kuroda Shinya
    Metabolic Engineering 15/2023-06-12
  • 機械学習を用いた緑内障・白内障同時手術後の視力予測
    中新井田 悠太; 清水 秀幸; 大野 聡; 徳毛 花菜; 尾上 弘光; 岡田 尚樹; 中倉 俊祐; ...
    第4回日本眼科AI学会総会/2023-11-23
  • more...
Intellectural property rights
  • 血糖上昇の有無を予測するための装置
    山田 哲也; 清水 秀幸; 小宮 力; 大野 聡; 古賀 大輔; 兼田 稜
Teaching
2020 -- 2026システム生物学東京大学
2015 -- 2022生物化学実験I東京大学
Other educational activities
2026 -- 2026令和8年度筑波大学公開講座 生命学際研究の最前線 2026筑波大学
Professional activities
2017-09 -- 2022-03新学術領域研究 代謝アダプテーションのトランスオミクス解析事務局
2017 -- (current)日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会委員

(Last updated: 2026-08-31)