INAGAKI Yuji

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Conference, etc.
  • AUTOEB:AU検定により系統樹の二分岐を評価するソフトウェア.
    番場浩平; 原田亮; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • Myzozoaにおけるオルガネラ局在DNAポリメラーゼの多様性と進化.
    稲垣 祐司; 原田亮
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • AUTOEB: A software for systematically evaluating bipartitions in a phylogenetic tree employing an approximately unbiased test.
    Kohei Bamba; Ryo Harada; INAGAKI Yuji
    第79回バイオ情報学研究会/2024-09-06--2024-09-06
  • アピコンプレクサおよびその近縁系統におけるオルガネラ局在DNAポリメラーゼの多様性と進化.
    稲垣 祐司; 原田亮
    奄美医科学研究シンポジウム/2024-10-02--2024-10-04
  • Dinotoms possess two evolutionary distinct autophagy-related ubiquitin-like conjugation systems.
    Euki Yazaki; Tadaaki Ueraha; Hirokazu Sakamoto; Inagak...
    Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2024/2024/07/07--2024/07/11
  • 光合成関連遺伝子に着目した緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムの解析.
    藤代彩花; 磯貝龍邑; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本藻類学会第48回大会/2024/03/22--2024/03/23
  • Transition of the gene repertoire with adaptation to parasitic lifestyle in Diplomonads: orthology analysis with related free-living species
    久米 慶太郎; 若島 朋幸; 厳 翼; 岩本 亮介; 井上 貴史; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 稲垣...
    The 93rd Annual Meeting of the Japanese Society of Parasitology/2024-03-09--2024-03-10
  • Exploring symbiotic cyanobacteria using size-fractionated environmental DNA samples.
    宮本知世; 矢吹彬憲; 野村真未; 柴小菊; 稲葉一男; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • Taxon sampling affects the internal relationship of Archaeplastida: Is either Rhodophyta or Glaucophyta the earliest branch in Archaeplastida?
    磯貝龍邑; 原田亮; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • Evolution of PCNA complex in Crenarchaota.
    上西慧莉紗; 原田亮; 吉永真理; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • A novel form of Rubisco that is ancestral to forms I and I’.
    番場浩平; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • 寄生性ユーグレナ類Euglenaformis parasiticaにおける非光合成性葉緑体の存在とその機能
    加藤孝一朗; 南波紀昭; 稲垣 祐司; 中山剛; 中山卓郎
    日本植物学会第87回大会/2023/09/07--2023/09/09
  • 最尤系統樹中の2分岐の信頼性に対する新たな評価手法.
    番場浩平; 稲垣 祐司; 原田亮; 中山卓郎; 磯貝龍邑
    第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会/2023-06-29--2023-07-01
  • AtLASS: A Scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM.
    原田亮; 久米慶太郎; 堀江和正; 中山卓郎; 稲垣 祐司; 天笠俊之
    第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会/2023-06-29--2023-07-01
  • Evolution and switching of mitochondrion-localized DNA polymerases in Euglenozoa.
    Ryo Harada; Hirakawa Yoshihisa; Yabuki Akinori; Kim Enso...
    3ʳᵈ Annual International Congress on Euglenoids 2023/2023/07/17--2023/07/18
  • A non-kareniacean dinoflagellate with a haptophyte-derived plastid indicates multiple tertiary endosymbioses.
    Takahashi Kazuya; Nakayama Takuro; Inagaki Yuji; Hehenber...
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Impact of taxon sampling on the relationship among Rhodophyta, Glaucophyta, and Chloroplastida inferred from nuclear gene-based phylogenomic analyses.
    Isogai Ryu; Ryo Harada; Nakayama Takuro; Inagaki Yuji
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Repeated haptophyte endosymbioses in the dinoflagellate family Kareniaceae.
    Inagaki Yuji; Benico Garry; Takahashi Kazuya; Ryo Harada...
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Has the DNA polymerase of the proto-mitochondrion been retained in Discoba, Malawimonadidae, and Ancyromonadida?: a novel mitochondrion-localized DNA polymerase with the phylogenetic affinity to the alpha-proteobacterial PolI.
    Ryo Harada; Inagaki Yuji
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Serial secondary and serial tertiary endosymbioses in dinoflagellates.
    Inagaki Yuji
    ICG seminor/2023/03/21--2023/03/21
  • Search for free-living-related proteins in free-living diplomonads that transitioned from a parasitic ancestor
    厳翼; 久米慶太郎; 阿部一貴; 矢﨑裕規; 小松崎洋志; 谷藤吾朗; 神川龍馬; 稲垣 祐司; 橋本哲男
    第92回寄生虫学会大会/2023/03/30--2023/03/31
  • 真核生物の大系統:最近の研究成果から見る多様性の広がり、まとまり、今後の展望
    稲垣 祐司
    第92回寄生虫学会大会サテライトシンポジウム 原生生物学・共生生物学談話会/2023/03/29--2023/03/29
  • Recent progress in resolving the diversity and evolution of deep eukaryotic phylogeny
    Inagaki Yuji
    ISEP23/2023/01/20--2023/01/20
  • A factor that hinders the accurate phylogenetic inferences: The monophyly of Archaeplastida as a case study.
    Inagaki Yuji
    EPCC-CCS Workshop 2022/2022-12-14--2022-12-15
  • Endosymbiotic origin of the DNA polymerase localized in euglenid plastids.
    Harada Ryo; Eliáš Marek; Inagaki Yuji
    2nd Annual International Congress of Euglenids/2022-11-07--2022-11-10
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