| 乾燥地生物資源の機能解析と有効利用 | 2010 -- 2015 | 礒田博子 | （独法）科学技術振興機構及び（独法）国際協力機構/地球規模課題対応国際科学技術協力プログラム | 117,553,800円 |
| トレーサーによる湖沼と流域での物質循環定量化と診断:時間軸と起源・過程情報の活用 | 2009 -- 2012 | 福島武彦 | 日本学術振興会/基盤研究(A) | 18,720,000円 |
| マルチ・トレーサー手法による流域水・物質循環プロセスのモデル化に関する研究 | 2005 -- 2007 | 辻村真貴 | 日本学術振興会/基盤研究(C) | 4,370,000円 |
| 森林荒廃が洪水・河川環境に及ぼす影響とモデル化 | 2003 -- 2008 | 恩田裕一 | （独法）科学技術振興機構/戦略的創造研究推進制度(CREST) | 250,000,000円 |
| 山体基盤岩地下水流動の実態解明とその水資源的評価 | 2002 -- 2005 | 嶋田 純 | 日本学術振興会/基盤研究(A) | 59,930,000円 |
| 北東アジア植生変遷域の水循環と生物・大気圏の相互作用の解明 | 2001-12 -- 2007-03 | 杉田倫明 | （独法）科学技術振興機構/戦略的創造研究推進制度(CREST) | 221,000,000円 |
| 源流域における同位体を用いた水循環プロセスの研究 | 2001 -- 2002 | 辻村真貴 | 日本学術振興会/基盤研究(C) | 3,200,000円 |
| 山地流域の水循環および水質形成過程に果たす谷底地下水域の役割に関する研究 | 1999 -- 2000 | 辻村真貴 | 日本学術振興会/奨励研究(A) | 2,300,000円 |
| 山地源流域における降雨流出過程および水質形成過程の一般化に関する研究 | 1997 -- 1998 | 辻村真貴 | 日本学術振興会/奨励研究(A) | 2,300,000円 |
| 山地源流域における地中水の流動過程と水質形成機構の関係に関する研究 | 1996 -- 1996 | 辻村真貴 | 日本学術振興会/奨励研究(A) | 1,100,000円 |