| 新たな根治的粒子線治療を実現する吸水性スペーサーの適応拡大と実用化研究 | 2017-04 -- 2020-03 | 佐々木良平 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構（AMED）/ | 2,000,000円 |
| 局所限局性前立腺癌中リスク症例に対する陽子線治療の多施設共同臨床試験 | 2016-11 -- 2019-03 | 櫻井英幸 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構/日本医療研究開発機構研究費/革新的がん医療実用化研究事業 | 53,979,000円 |
| 加速器型治療装置によるホウ素中性子捕捉療法（BNCT）の医師主導治験 | 2015-11 -- 2018-03 | 櫻井英幸 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構/医療機器開発推進研究事業 | 179,985,000円 |
| 陽子線治療の有用性の検証に関する多施設共同研究 | 2015-09 -- 2016-03 | 櫻井英幸 | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構/革新的がん医療実用化研究事業 | 29,000,000円 |
| 次世代型マルチ粒子線治療の臨床応用のための基盤研究 | 2015 -- 2018 | 櫻井英幸 | 日本学術振興会/基盤研究(B) | 15,090,000円 |
| 筑波大学・ドイツ学術交流会（ＤＡAD)パートナーシップ・プログラム | 2014-04 -- 2016-03 | 櫻井英幸 | 筑波大学/筑波大学・ドイツ学術交流会（ＤＡAD)パートナーシップ・プログラム | 1,808,000円 |
| 小型陽子線加速器ベースの中性子発生プラントの構築による医療用中性子ビームの実証評価 | 2011-09 -- 2013-03 | 櫻井英幸 | 経済産業省 「イノベーション拠点立地支援事業 企業等の実証・評価設備等の整備事業」/国内共同研究 | 449,790,000円 |
| 中性子捕捉療法用病院併設型小型直線加速器の研究開発 | 2011-03 -- 2013-03 | 櫻井英幸 | （独）新エネルギー・産業技術総合開発機構/国内共同研究 | 450,000,000円 |
| 高エネルギー陽子ビームを用いた次世代型粒子線治療のための研究 | 2012 -- 2014 | 櫻井英幸 | 日本学術振興会/基盤研究(B) | 17,940,000円 |
| 極小量子ビームを用いた細胞内元素分布解析による疾患機序の解明 | 2012 -- 2013 | 櫻井英幸 | 日本学術振興会/挑戦的萌芽研究 | 3,770,000円 |
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