| トマトの単為結果の分子機構解明 | 2011-08 -- 2016-03 | 江面 浩 | イノベーション創出基礎的研究推進事業（技術シーズ開発型）/ | |
| メタボロミクスアプローチによるHMGR過剰発現トマトに対する実質的同等性評価 | 2011-04 -- 2012-03 | 草野 都 | /平成23年度 筑波大学共同利用・共同研究「形質転換植物デザイン研究拠点」 | 500,000円 |
| 大地環境変動に対する植物の生存・成長突破力の分子的統合解析 | 2010-04 -- 2015-03 | 馬 建鋒 | 文部科学省/新学術領域研究（研究領域提案型） | 50,000,000円 |
| メタボロミクスによる形質転換植物の代謝物変動モニタリング法 | 2010-04 -- 2011-03 | 草野 都 | 筑波大学/平成22年度 筑波大学共同利用・共同研究「形質転換植物デザイン研究拠点」 | 450,000円 |
| 野菜等の光応答メカニズムの解明と省エネルギー，コスト削減利用技術の開発 | 2009-04 -- 2014-03 | 松井 南 | 農林水産省/農林水産省委託プロジェクト研究 | |
| イネ完全長cDNAによる有用形質高速探索 | 2005-07 -- 2007-03 | 松井 南 | 文部科学省/科学技術振興調整費 | 37,500,000円 |