DOI Yuki
- Affiliation
- Institute of Life and Environmental Sciences
- Official title
- Assistant Professor
- Research fields
Applied microbiology - Research projects
土壌細菌Ralstonia sp. XP-1株のキサントプテリン分解機構の解明 2024-04 -- 2027-03 DOI Yuki Japan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research(C) 4,550,000Yen Cupriavidus sp. LA-1株のプテリン分解遺伝子の発現制御機構の解明と応用 2023-04 -- 2024-03 土肥 裕希 野田産業科学研究所/奨励研究助成 1,000,000Yen 放線菌Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明 2021-04 -- 2024-03 土肥 裕希 日本学術振興会/科学研究費補助金(基盤C) 4,160,000Yen 葉酸資化性菌Ralstonia sp. LA-1株のルマジン異化経路の同定 2021-04 -- 2023-03 土肥 裕希 加藤記念バイオサイエンス振興財団/加藤記念研究助成 2,000,000Yen 乳酸菌に見出された酸素応答性の好気性グリセロール代謝制御機構の解明 2016-04 -- 2018-03 土肥 裕希 日本学術振興会/科学研究費補助金(若手B) 4,030,000Yen グリセロール資化性乳酸菌Enterococcus faecalisが行う好気性乳酸発酵の発現条件の解明とそれを利用した廃棄グリセロール再資源化技術の構築 2016-04 -- 2018-03 土肥 裕希 公益財団法人発酵研究所/一般研究助成 3,000,000Yen 乳酸菌Enterococcus faecalisのピルビン酸-ギ酸リアーゼ活性応答性の嫌気性グリセロール代謝制御因子の同定 2015-04 -- 2016-03 土肥 裕希 笹川科学研究助成/学術研究部門 770,000Yen 廃グリセロールを原料としたD-乳酸の生物学的生産 -高純度なD-乳酸の生産に向けた新規アプローチ- 2015-05 -- 2016-03 土肥 裕希 岡山工学振興会/学術研究助成 375,000Yen 新奇乳酸菌を用いた廃グリセリン再資源化技術の実用化研究開発 2014-04 -- 2015-03 土肥 裕希 日本石鹸洗剤工業会/グリセリン新規用途開発研究助成 500,000Yen - Career history
2020-02 -- (current) 筑波大学生命環境系助教 2019-10 -- 2020-01 筑波大学生命環境系博士研究員 2012-06 -- 2019-09 岡山理科大学工学部研究員 2011-10 -- 2012-05 広島工業大学情報学部博士研究員 2011-04 -- 2011-09 筑波大学大学院生命環境科学研究科博士特別研究員 - Academic background
2008-04 -- 2011-03 筑波大学大学院 生命環境科学研究科 博士後期課程 生物機能科学専攻 2006-04 -- 2008-03 岡山理科大学大学院 工学研究科 応用化学専攻 修士課程 2002-04 -- 2006-03 岡山理科大学 工学部 応用化学科 - Degree
2011-03 博士(農学) 筑波大学大学院 - Academic societies
2015 -- (current) アメリカ微生物学会 2006-04 -- (current) 環境バイオテクノロジー学会 2006-04 -- (current) 日本農芸化学会 - Honors & Awards
2014-06 科学技術賞 2008-03 学生奨励賞 2006-03 学生奨励賞 - Articles
- Protocatechuate hydroxylase is a novel group A flavoprotein monooxygenase with a unique substrate recognition mechanism
Katsuki Nozomi; Fukushima Riku; Doi Yuki; Masuo Shuns...
The Journal of biological chemistry/300(1), 2024-01-01 - The Metabolic Regulation of Amino Acid Synthesis Counteracts Reactive Nitrogen Stress via Aspergillus nidulans Cross-Pathway Control
Amahisa Madoka; Tsukagoshi Madoka; Kadooka Chihiro; Ma...
JOURNAL OF FUNGI/10(1), 2024-01-10 - Carboxypeptidase G and pterin deaminase metabolic pathways degrade folic acid in Variovorax sp. F1
You Yungmi; Doi Yuki; Maeda Norifumi; Masuo Shunsuke; ...
BMC microbiology/22(1)/p.225, 2022-09-27 - Symbiotic riboflavin degradation by Microbacterium and Nocardioides bacteria
Kanazawa Hiroshi; Ozaki Sayoko; Doi Yuki; Masuo Shunsuke...
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY/84(5)/pp.1056-1061, 2020-05 - Correction to: Glycerol metabolism and its regulation in lactic acid bacteria
Doi Yuki
Applied microbiology and biotechnology/103(13)/p.5459, 2019-04-01 - Glycerol metabolism and its regulation in lactic acid bacteria
Doi Yuki
Applied microbiology and biotechnology/103(13)/pp.5079-5093, 2019-07-01 - Lactic acid fermentation is the main aerobic metabolic pathway in Enterococcus faecalis metabolizing a high concentration of glycerol
Doi Yuki
Applied microbiology and biotechnology/102(23)/pp.10183-10192, 2018-12-01 - Complete Genome Sequence of Enterococcus faecalis Strain W11 Isolated from an Algal Food Product
Doi Yuki; Takizawa Noboru
Genome announcements/4(5), 2016-09-29 - L-lactate production from biodiesel-derived crude glycerol by metabolically engineered Enterococcus faecalis: cytotoxic evaluation of biodiesel waste and development of a glycerol-inducible gene expression system
Doi Yuki
Applied and environmental microbiology/81(6)/pp.2082-2089, 2015-03-01 - A Novel A3 Group Aconitase Tolerates Oxidation and Nitric Oxide
Doi Yuki; Takaya Naoki
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY/290(3)/pp.1412-1421, 2015-01 - Hydrazidase, a Novel Amidase Signature Enzyme That Hydrolyzes Acylhydrazides
Oinuma Ken-Ichi; Takuwa Atsushi; Taniyama Kosuke; Doi Yu...
JOURNAL OF BACTERIOLOGY/197(6)/pp.1115-1124, 2015-03 - Pyruvate formate-lyase is essential for fumarate-independent anaerobic glycerol utilization in the Enterococcus faecalis strain W11
Doi Yuki; Ikegami Yuki
Journal of bacteriology/196(13)/pp.2472-2480, 2014-07-01 - Achromobacter denitrificans Strain YD35 Pyruvate Dehydrogenase Controls NADH Production To Allow Tolerance to Extremely High Nitrite Levels
Doi Yuki; Shimizu Motoyuki; Fujita Tomoya; Nakamura Akir...
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY/80(6)/pp.1910-1918, 2014-03 - NO-inducible nitrosothionein mediates NO removal in tandem with thioredoxin
Zhou Shengmin; Narukami Toshiaki; Masuo Shunsuke; Shimizu...
NATURE CHEMICAL BIOLOGY/9(10)/pp.657-663, 2013-10 - Hydrolase controls cellular nicotinamide adenine dinucleotide, sirtuin and secondary metabolites
Shimizu M.; Masuo S.; Fujita T.; Doi Y.; Kamimura Y.; Tak...
Mol. Cell. Biol./32(18)/pp.3743-3755, 2012-01 - Novel fungal phenylpyruvate reductase belongs to d-isomer-specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family
Fujii Taiki; Shimizu Motoyuki; Doi Yuki; Fujita Tomoya; I...
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS/1814(12)/pp.1669-1676, 2011-12 - Novel denitrifying bacterium Ochrobactrum anthropi YD50.2 tolerates high levels of reactive nitrogen oxides.
Doi Y.; Takaya N.; Takizawa N.
Appl. Environment. Microbiol./75(16)/pp.5186-5194, 2009-08
- Protocatechuate hydroxylase is a novel group A flavoprotein monooxygenase with a unique substrate recognition mechanism
- Conference, etc.
- Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明
塩田 大地; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2024年度大会/2024-03-23--2024-03-28 - Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明
塩田 大地; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本微生物生態学会 第36回大会/2023-11-27--2023-11-30 - Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解を担う新規Cytochrome P450水酸化酵素の解析
土肥 裕希; 塩田 大地; 高谷 直樹
日本農芸化学会 関東支部 2023年度大会/2023-08-25--2023-08-25 - Rhodococcus sp. LC-2 株のルミクロム分解機構の解明
塩田 大地; 土肥 裕希; 高谷 直樹
環境バイオテクノロジー学会 2023年度大会/2023-06-08--2023-06-09 - Cupriavidus sp. LA-1株のプテリジン化合物分解機構の解明
土肥 裕希; 前田 典歩; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2023年度大会/2023-03-14--2023-03-17 - 環境土壌における葉酸資化性菌の群衆構造解析
戸田 征宏; 前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2023年度大会/2023-03-14--2023-03-17 - L-glucose資化菌の微生物生態学的解析と代謝機構の解析
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
日本農芸化学会2023年度大会/2023-03-14--2023-03-17 - 細菌によるプテリジン分解機構の解明
前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
環境バイオテクノロジー学会 2022年度大会/2022-11-21--2022-11-22 - 土壌微生物によるプテリジン色素分解機構の解明
前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本微生物生態学会 第35回大会/2022-10-31--2022-11-03 - L-glucose資化菌の微生物生態学的解析と代謝機構の解析
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
第20回微生物研究会/2022-10-29--2022-10-29 - Ecological Analysis of L-Glucose Utilizing Bacteria in the Field Soil and Their Isolation
Akihito Hama; Yuki Doi; Akira Nakamura
第14回日中韓国際大学院生アカデミックフォーラム/2022-09-27--2022-09-28 - Cupriavidus sp. LA-1株によるルマジン分解機構の解明
前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 関東支部 2022年度大会/2022-08-27 - Lumazine utilization pathway in Cupriavidus sp. strain LA-1
Maeda Norifumi; Doi Yuki; Takaya Naoki
International Union of Microbiological Societies 2022/2022-07-20--2022-07-22 - Symbiotic folate degradation by Variovorax and other bacteria
Doi Yuki; Maeda Norifumi; Takaya Naoki
International Union of Microbiological Societies 2022/2022-07-20--2022-07-22 - 微生物分解を介した葉酸の新たな環境動態
土肥 裕希; 前田 典歩; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2022年度大会/2022-03-15--2022-03-18 - 微生物生態系におけるルミクロム分解機構の解明
鈴木 麻菜美; 前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2022年度大会/2022-03-15--2022-03-18 - Cupriavidus sp. LA-1 株によるルマジン分解機構の解明
前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2022年度大会/2022-03-15--2022-03-18 - マイクロウェルアレイを用いた新たな微生物の分離培養法の構築
沼館 美法; 佐々 文洋; 土肥 裕希; 桝尾 俊介; 竹下 典男; 高谷 直樹
日本農芸化学会 2022年度大会/2022-03-15--2022-03-18 - 土壌培養と液体集積培養の違いによるL-glucose資化菌の菌叢変化
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
日本農芸化学会 2022年度大会/2022-03-15--2022-03-18 - L-glucose資化菌のスクリーニングと代謝機構の解析
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
MiCSワークショップ/2022-03-04--2022-03-04 - Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明
鈴木 麻菜美; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 関東支部 2021年度大会/2021-11-27--2021-11-27 - 細菌によるルマジン分解機構の解明
前田 典歩; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本農芸化学会 関東支部 2021年度大会/2021-11-27--2021-11-27 - 16S amplicon解析を用いたL-glucose添加による土壌菌叢の変化
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
日本農芸化学会 関東支部 2021年度大会/2021-11-27--2021-11-27 - 土壌培養と液体集積培養の違いによる L-glucose資化菌の菌叢変化
濱 彰人; 土肥 裕希; 中村 顕
第19回微生物研究会/2021-11-04--2021-11-04 - 土壌微生物生態系におけるリボフラビン動態
鈴木 麻菜美; 土肥 裕希; 高谷 直樹
日本微生物生態学会 第34回大会/2021-10-30--2021-11-02 - more...
- Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明
- Intellectural property rights
- 形質転換体およびそれを用いたD-乳酸の生産方法
土肥 裕希
- 形質転換体およびそれを用いたD-乳酸の生産方法
- Teaching
2024-04 -- 2024-08 Seminar in Applied Biochemistry IIF(Spring) University of Tsukuba. 2024-04 -- 2024-08 Seminar in Life and Agricultural Sciences University of Tsukuba. 2024-10 -- 2025-02 Seminar in Life and Agricultural Sciences University of Tsukuba. 2024-10 -- 2025-02 Research in Applied Biochemistry IF University of Tsukuba. 2024-04 -- 2024-08 Research in Applied Biochemistry IIS University of Tsukuba. 2024-04 -- 2024-08 Seminar in Applied Biochemistry IIS University of Tsukuba. 2024-10 -- 2025-02 Dissertation in Applied Microbiology III University of Tsukuba. 2024-04 -- 2024-08 Dissertation in Applied Microbiology III University of Tsukuba. 2024-10 -- 2025-02 Research in Applied Biochemistry IIF University of Tsukuba. 2024-10 -- 2025-02 Seminar in Applied Biochemistry IF University of Tsukuba. more...
(Last updated: 2024-08-27)