中山 卓郎(ナカヤマ タクロウ)

所属
計算科学研究センター
職名
助教
ORCID
0000-0001-5135-0156
科研費番号
70583508
URL
研究課題
二次共生の中間段階にある共生者ゲノムの解読2024-04 -- 2027-03中山 卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(c)(一般）4,550,000円
非光合成生物の産生する光毒性色素の機能と地理的分布の解明2021-07 -- 2023-03谷藤 吾朗日本学術振興会/挑戦的研究(萌芽)6,370,000円
海洋微生物多様性の盲点―真核微生物に潜在する原核微生物叢の実態を探る2020-04 -- 2024-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(B)17,680,000円
ケルコゾア生物における“ミトコンドリア型解糖系”の理解に向けた基礎的研究2014-04 -- 2017-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 若手研究(B)3,900,000円
光合成補助色素フコキサンチンの未知なる生合成系の解明とその誕生の謎を紐解く2019-04 -- 2024-03神川 龍馬日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(B)17,290,000円
海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明2018-10 -- 2023-03稲垣 祐司日本学術振興会/科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))17,810,000円
渦鞭毛藻細胞に見られるシアノバクテリア共生体の機能および進化の解明2017-04 -- 2020-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 若手研究(B)4,290,000円
細胞内共生を通じた新奇オルガネラ獲得:珪藻細胞に見られる窒素固定構造の進化解明2010-01 -- 2011-01中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 研究活動スタート支援2,470,000円
Paulinella chromatophoraのシアネレに関する研究2007-01 -- 2009-01中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 特別研究員奨励費2,700,000円
職歴
2021-04 -- (現在)筑波大学計算科学研究センター助教
2016-11 -- 2021-03東北大学データ科学国際共同大学院助教
2016-11 -- 2021-03東北大学生命科学研究科助教
2013-06 -- 2016-10筑波大学計算科学研究センター研究員
2011-06 -- 2013-06ダルハウジー大学日本学術振興会 海外特別研究員
2010-04 -- 2011-06国立環境研究所NIESポスドクフェロー
2007-04 -- 2010-03日本学術振興会 特別研究員 DC1
取得学位
2010-03博士（理学）筑波大学
2007-03修士（理学）金沢大学
2005-03学士（理学）金沢大学
所属学協会
2012-03 -- (現在)International Society of Protistologists
2017-04 -- (現在)日本共生生物学会
2005-03 -- (現在)日本藻類学会
2011-09 -- (現在)日本植物学会
-- (現在)日本藻類学会
-- (現在)日本植物学会
受賞
2022-04-20筑波大学若手教員特別奨励賞
2022-04-20科学技術分野の文部科学大臣表彰　若手科学者賞
2021-09-19日本植物学会賞奨励賞
2015-03日本藻類学会研究奨励賞
論文
著書
  • 2-8-3. アピコンプレクサ; 2-9-1. ケルコゾア; 3-14 共生体からオルガネラへの進化
    中山 卓郎
    原生生物学事典/朝倉書店, 2023-05
会議発表等
  • 珪藻に共生する窒素固定シアノバクテリアと「ニトロプラスト」
    中山 卓郎
    藍藻の分子生物学2024/2024-12-13--2024-12-14
  • 緑色渦鞭毛藻TGD株にみられるヌクレオモルフのゲノム解析 ー既知ヌクレオモルフゲノムとの共通点・相違点を探るー
    藤代彩花; 磯貝龍邑; 鈴木重勝; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • Metamonadaとの近縁性が示唆される好気性原生生物の系統分類学的研究．
    白鳥峻志.; 原田亮; 磯貝龍邑; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • 単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム．
    原田亮; 西村祐貴; 野村真未; 矢吹彬憲; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本微生物生態学会第37回大会/2024-10-28--2024-10-31
  • 原生生物の核ゲノム転写物におけるRNA Editingの探索．
    磯貝龍邑; 原田亮; 矢﨑裕規; 中山卓郎; 稲垣 祐司; 矢吹彬憲
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • 様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン
    望月 孝子; 坂本 美佳; 谷澤 靖洋; 中山 卓郎; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 中村 保一
    日本育種学会 第145回講演会/2024-03-16--2024-03-17
  • 光合成関連遺伝子に着目した緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムの解析．
    藤代彩花; 磯貝龍邑; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本藻類学会第48回大会/2024/03/22--2024/03/23
  • 様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン
    望月 孝子; 坂本 美佳; 谷澤 靖洋; 中山 卓郎; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 中村 保一
    第46回 日本分子生物学会年会/2023-12-07--2023-12-07
  • 細胞サイズ別環境 DNA を用いた共生性シアノバクテリアの探索．
    宮本知世; 矢吹彬憲; 野村真未; 柴小菊; 稲葉一男; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • 一次植物内部系統関係におけるタクソンサンプリングの影響：紅藻類と灰色藻類のどちらが初期分岐系統なのか？
    磯貝龍邑; 原田亮; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第7回大会/2023-11-18--2023-11-19
  • 寄生性ユーグレナ類Euglenaformis parasiticaにおける非光合成性葉緑体の存在とその機能
    加藤孝一朗; 南波紀昭; 稲垣 祐司; 中山剛; 中山卓郎
    日本植物学会第87回大会/2023/09/07--2023/09/09
  • 現在進行中の細胞内共生進化を観察する：配列データから得た進化のスナップショット
    中山 卓郎
    第25回デジタル進化生物セミナー/2022-09-01
  • 最尤系統樹中の2分岐の信頼性に対する新たな評価手法．
    番場浩平; 稲垣 祐司; 原田亮; 中山卓郎; 磯貝龍邑
    第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会/2023-06-29--2023-07-01
  • AtLASS: A Scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM.
    原田亮; 久米慶太郎; 堀江和正; 中山卓郎; 稲垣 祐司; 天笠俊之
    第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会/2023-06-29--2023-07-01
  • A non-kareniacean dinoflagellate with a haptophyte-derived plastid indicates multiple tertiary endosymbioses.
    Takahashi Kazuya; Nakayama Takuro; Inagaki Yuji; Hehenber...
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Impact of taxon sampling on the relationship among Rhodophyta, Glaucophyta, and Chloroplastida inferred from nuclear gene-based phylogenomic analyses.
    Isogai Ryu; Ryo Harada; Nakayama Takuro; Inagaki Yuji
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Repeated haptophyte endosymbioses in the dinoflagellate family Kareniaceae.
    Inagaki Yuji; Benico Garry; Takahashi Kazuya; Ryo Harada...
    IX ECOP-ISOP joint meeting 2023/2023/07/09--2023/07/14
  • Paulinella microporaにおけるマイクロボディの局在とその機能推定
    野村 真未; 中山 卓郎; 中村 桂一郎; 太田 啓介
    日本植物学会 第86回大会/2022-09-17--2022-09-19
  • 栽培される共生体：海洋渦鞭毛藻とシアノバクテリアの共生関係
    中山 卓郎
    日本植物学会 第86回大会/2022-09-17--2022-09-19
  • 原生生物に共生するシアノバクテリアの進化と多様性に関する研究
    中山 卓郎
    日本植物学会 第85回大会/2021-09-18--2021-09-19
  • 有殻アメーバ直伝,卵型シェルターの作り方
    野村真未; 西上幸範; 中山 卓郎; 市川正敏; 太田啓介; 中村桂一郎
    日本植物生理学会年会/2021-03-16
  • 様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価
    望月 孝子; 坂本 美佳; 谷澤 靖洋; 中山 卓郎; 谷藤 吾朗; 神川 龍馬; 中村 保一
    日本分子生物学会年会/2021-12-01--2021-12-03
  • Draft nucleomorph genomes of green-colored dinoflagellates
    Inagaki Yuji; Nakayama Takuro; Kawakubo Takashi; Matsuo ...
    21st Symposium of the International Society of Endocytobiology/2022-7-19--2022-7-22
  • Diversity of symbiotic cyanobacteria seen in pelagic dinoflagellates
    Nakayama Takuro
    The 4th Asian Congress of Protistology/2021-11-18--2021-11-21
  • 緑色渦鞭毛藻Lepidodinium chlorophorumにおけるヌクレオモルフゲノムの存在検証
    中山卓郎; 稲垣 祐司
    日本藻類学会第46回大会/2022-03-29--2022-03-30
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担当授業科目
2024-10 -- 2025-02生物科学概論II筑波大学
2024-10 -- 2025-02ゲノム情報学セミナーVF筑波大学
2024-07 -- 2024-07基礎生物学実験II筑波大学
2024-10 -- 2025-02ゲノム情報学研究法IIF筑波大学
2024-12 -- 2025-02基礎生物学実験III筑波大学
2024-04 -- 2024-08ゲノム情報学セミナーIIIS筑波大学
2024-04 -- 2024-08ゲノム情報学研究法IS筑波大学
2024-10 -- 2025-02ゲノム情報学セミナーIIIF筑波大学
2024-10 -- 2025-02ゲノム情報学研究法IF筑波大学
2024-04 -- 2024-08ゲノム情報学講究S筑波大学
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一般講演
  • ミクロで起きている大進化！シアノバクテリアと微生物の細胞内共生
    中山 卓郎
    日本植物学会一般向け講演会/2022-12-11
  • A model for endosymbiotic genome reduction: epithemiacecan diatoms and their nitrogen-fixing organelle, spheroid body.
    Yuji Inagaki; Takuro Nakayama; Ryoma Kamikawa.
    Protist2012/2012-07-29--2012-08-03

(最終更新日: 2025-05-09)