中山 卓郎(ナカヤマ タクロウ)

所属
計算科学研究センター
職名
助教
ORCID
0000-0001-5135-0156
科研費番号
70583508
URL
研究課題
極小ゲノムを持つ新奇古細菌系統の実態解明2025-04 -- 2027-03中山卓郎財団法人発酵研究所/一般研究助成
二次共生の中間段階にある共生者ゲノムの解読2024-04 -- 2027-03中山 卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(c)(一般）4,550,000円
非光合成生物の産生する光毒性色素の機能と地理的分布の解明2021-07 -- 2023-03谷藤 吾朗日本学術振興会/挑戦的研究(萌芽)6,370,000円
海洋微生物多様性の盲点―真核微生物に潜在する原核微生物叢の実態を探る2020-04 -- 2024-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(B)17,680,000円
ケルコゾア生物における“ミトコンドリア型解糖系”の理解に向けた基礎的研究2014-04 -- 2017-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 若手研究(B)3,900,000円
光合成補助色素フコキサンチンの未知なる生合成系の解明とその誕生の謎を紐解く2019-04 -- 2024-03神川 龍馬日本学術振興会/科学研究費助成事業 基盤研究(B)17,290,000円
海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明2018-10 -- 2023-03稲垣 祐司日本学術振興会/科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))17,810,000円
渦鞭毛藻細胞に見られるシアノバクテリア共生体の機能および進化の解明2017-04 -- 2020-03中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 若手研究(B)4,290,000円
細胞内共生を通じた新奇オルガネラ獲得:珪藻細胞に見られる窒素固定構造の進化解明2010-01 -- 2011-01中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 研究活動スタート支援2,470,000円
Paulinella chromatophoraのシアネレに関する研究2007-01 -- 2009-01中山卓郎日本学術振興会/科学研究費助成事業 特別研究員奨励費2,700,000円
職歴
2021-04 -- (現在)筑波大学計算科学研究センター助教
2016-11 -- 2021-03東北大学データ科学国際共同大学院助教
2016-11 -- 2021-03東北大学生命科学研究科助教
2013-06 -- 2016-10筑波大学計算科学研究センター研究員
2011-06 -- 2013-06ダルハウジー大学日本学術振興会 海外特別研究員
2010-04 -- 2011-06国立環境研究所NIESポスドクフェロー
2007-04 -- 2010-03日本学術振興会 特別研究員 DC1
取得学位
2010-03博士（理学）筑波大学
2007-03修士（理学）金沢大学
2005-03学士（理学）金沢大学
所属学協会
2012-03 -- (現在)International Society of Protistologists
2017-04 -- (現在)日本共生生物学会
2005-03 -- (現在)日本藻類学会
2011-09 -- (現在)日本植物学会
-- (現在)日本藻類学会
-- (現在)日本植物学会
受賞
2022-04-20筑波大学若手教員特別奨励賞
2022-04-20科学技術分野の文部科学大臣表彰　若手科学者賞
2021-09-19日本植物学会賞奨励賞
2015-03日本藻類学会研究奨励賞
論文
著書
  • 2-8-3. アピコンプレクサ; 2-9-1. ケルコゾア; 3-14 共生体からオルガネラへの進化
    中山 卓郎
    原生生物学事典/朝倉書店, 2023-05
会議発表等
  • 微生物ゲノムの縮小進化に見る「生き方」と「自立性」
    中山 卓郎
    Life-Nonlife Seminar / IMS Online Seminar/2026-06-15
  • 「ニトロプラスト」への道：珪藻・ハプト藻の細胞内共生体に見る進化様式
    中山 卓郎
    第67回日本植物生理学会年会関連集会 第5回原核光合成生物シンポジウム/2026-03-12
  • 「極小の炭素循環系」としての渦鞭毛藻共生圏
    中山 卓郎
    日本微生物生態学会第38回大会/2025-09-08
  • An ultra-reduced archaeon from host-associated microbial dark matter.
    Ryo Harada; Yuki Nishimura; Mami Nomura; Akinori Yabu...
    ISE meeting 2026/2026-09-14--2026-09-18
  • Symbiont genomes from a single eukaryotic cell shed light on microbial dark matter
    NAKAYAMA Takuro
    17th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences/2025-10-06--2025-10-07
  • Microscopy and phylogenomics of novel deep-branching CRuMs.
    Packer Julia; Harada Ryo; Isogai Ryu; Nakayama Takuro...
    Protist Open 2026/2026-04-19--2026-04-23
  • Recent plastid replacement in Karlodinium ballantinum challenges the paradigms of endosymbiotic gene transfer.
    Maciszewski Kacper; Takahashi Kazuya; Harada Ryo; Mart...
    Protist Open 2026/2026-04-19--2026-04-23
  • テトラヒメナの繊毛運動を制御する新奇アクチン関連タンパク質 tArp
    加川海来; 萩田美乃里; 中山卓郎; 柴小菊; 箕浦高子; 松田真弥; 稲葉一男; 稲垣祐司; 中野賢太郎
    生体運動研究合同班会議 2026/2026-1-9--2026-1-11
  • Non-parametric bootstrap with the PMSF model can overestimate support values.
    Ryu Isogai; Ryo Harada; Takuro Nakayama; INAGAKI Yuji
    Protist Open 2026/2026-04-19--2026-04-23
  • Draft nucleomorph genome of the dinoflagellate strain TGD.
    Ayaka Fujishiro; Ryu Isogai; Shigekatsu Suzuki; Kazuya...
    Protist Open 2026/2026-04-19--2026-04-23
  • メタモナダに近縁性が示唆された真核微生物2株のミトコンドリアゲノム解析．
    松浦眞子; 磯貝龍邑; 原田亮; 白鳥峻志; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会 合同大会/2025-11-28--2025-12-01
  • 系統解析において座位ごとのアミノ酸組成をモデル化する手法(PMSF)に起因するバイアスの検証．
    磯貝龍邑; 原田亮; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会 合同大会/2025-11-28--2025-12-01
  • 真核生物におけるDNAポリメラーゼθの多様性とユーグレノゾア特異的ミトコンドリアDNAポリメラーゼPolIAの起源．
    魏明哲; 磯貝龍邑; 原田亮; 矢﨑裕規; 中山卓郎; Ryan Gawryluk; 稲垣 祐司
    第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会 合同大会/2025-11-28--2025-12-01
  • 緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムが示す二次共生ゲノム進化の新たなスナップショット
    藤代彩花; 磯貝龍邑; 鈴木重勝; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本植物学会第89回大会/2025-09-18--2025-09-20
  • 光合成をやめたシアノバクテリアのゲノム進化
    中山 卓郎
    大隅基礎科学創成財団 微生物機能探究コンソーシアムG4定例会/2025-06-17
  • tARP is an actin-related protein required for ciliary function that is conserved in ciliates and related eukaryotic groups.
    Kagawa Miku; Takuro Nakayama; Shiba Kogiku; Takako Ka...
    第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会/2025/07/16--2025/07/18
  • Thermoproteota門古細菌におけるPCNA進化．
    上西慧莉紗; 原田亮; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    第37回Archaea研究会/2025/07/18--2025/07/19
  • Recent plastid replacement in Karlodinium ballantinum (Kareniaceae, Dinoflagellata) challenges the paradigms of endosymbiotic gene transfer.
    Maciszewski Kacper; Takahashi Kazuya; Harada Ryo; Mart...
    ICOP/ISOP2025/2025/06/22--2025/06/27
  • Nucleomorph genome of the dinoflagellate TGD reveals an early stage of genome reduction following secondary endosymbiosis.
    Fujishiro Ayaka; Isogai Ryu; Suzuki Shigekatsu; Takaha...
    ICOP/ISEP2025/2025/06/22--2025/06/27
  • On the tree of Archaeplastida: The impact of rapidly evolving and heterotachious positions on nuclear and plastid phylogenomic inferences.
    Isogai Ryu; Harada Ryo; Nakayama Takuro; INAGAKI Yuji
    ICOP/ISEP2025/2025/06/22--2025/06/27
  • Hidden microbial diversity: Novel microbial lineages discovered in dinoflagellate symbioses
    NAKAYAMA Takuro
    AIMEC Science Salon/2025-04-08
  • 珪藻に共生する窒素固定シアノバクテリアと「ニトロプラスト」
    中山 卓郎
    藍藻の分子生物学2024/2024-12-13--2024-12-14
  • 緑色渦鞭毛藻TGD株にみられるヌクレオモルフのゲノム解析 ー既知ヌクレオモルフゲノムとの共通点・相違点を探るー
    藤代彩花; 磯貝龍邑; 鈴木重勝; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • Metamonadaとの近縁性が示唆される好気性原生生物の系統分類学的研究．
    白鳥峻志.; 原田亮; 磯貝龍邑; 中山卓郎; 稲垣 祐司
    日本共生生物学会第8回大会/2024-10-19--2024-10-20
  • 単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム．
    原田亮; 西村祐貴; 野村真未; 矢吹彬憲; 稲垣 祐司; 中山卓郎
    日本微生物生態学会第37回大会/2024-10-28--2024-10-31
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担当授業科目
2026-01 -- 2026-02基礎生物学実験III筑波大学
2025-10 -- 2025-12基礎生物学実験II筑波大学
2025-07 -- 2025-07基礎生物学実験II筑波大学
2025-04 -- 2025-07基礎生物学実験I筑波大学
2025-04 -- 2025-08ゲノム情報学講究S筑波大学
2025-10 -- 2026-02ゲノム情報学講究F筑波大学
2025-04 -- 2025-08ゲノム情報学研究法IS筑波大学
2025-04 -- 2025-08ゲノム情報学研究法IIS筑波大学
2025-10 -- 2026-02ゲノム情報学研究法IIF筑波大学
2025-10 -- 2026-02ゲノム情報学研究法IF筑波大学
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一般講演
  • ミクロで起きている大進化！シアノバクテリアと微生物の細胞内共生
    中山 卓郎
    日本植物学会一般向け講演会/2022-12-11
  • A model for endosymbiotic genome reduction: epithemiacecan diatoms and their nitrogen-fixing organelle, spheroid body.
    Yuji Inagaki; Takuro Nakayama; Ryoma Kamikawa.
    Protist2012/2012-07-29--2012-08-03
学協会等委員
2026-01 -- (現在)日本共生生物学会会員担当理事
2024-01 -- 2025-12日本共生生物学会庶務担当理事
学内管理運営業績
2024-04 -- 2025-03研究員会議書記（計算科学研究センター）
2022-04 -- (現在)大学説明会委員会（生物学類）
2022-04 -- (現在)生物系D棟サブネットワーク管理委員
2022-04 -- (現在)広報・HP委員（生物学学位プログラム）
2025-04 -- (現在)一般利用委員会（計算科学研究センター）
その他の活動
2025-07 -- 2025-07USA Today「What is life? A little microbe raises big questions.」 Sukunaarchaeumの発見に関する研究成果が紹介（インタビューコメント掲載） https://www.usatoday.com/story/news/nation/2025/07/06/microbe-raises-questions-about-life/84428810007/
2025-08 -- 2025-08Nautilus Magazine 「A Rogue New Life Form」Sukunaarchaeumの発見に関する研究成果が紹介（取材コメント掲載） https://nautil.us/a-rogue-new-life-form-1232095
2025-11 -- 2025-11Quanta Magazine 特集記事「A Cell So Minimal That It Challenges Definitions of Life」 Sukunaarchaeumを主題とする特集記事として研究内容が紹介（取材コメント） https://www.quantamagazine.org/a-cell-so-minimal-that-it-challenges-definitions-of-life-20251124/
2025-06 -- 2025-06Science (AAAS) ニュース記事「Microbe with bizarrely tiny genome may be evolving into a virus」 Sukunaarchaeumの発見と進化微生物学的位置づけに関する研究成果が紹介（取材コメント） https://www.science.org/content/article/microbe-bizarrely-tiny-genome-may-be-evolving-virus

(最終更新日: 2026-08-11)