堤 真人(ツツミ マサト)

所属
生存ダイナミクス研究センター
職名
助教
ORCID
0009-0005-0211-1702
学外所属
名古屋大学 大学院医学系研究科附属神経疾患・腫瘍分子医学研究センター細胞情報統合解析部門データ駆動生物学研究室客員研究員
研究分野
生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
生命・健康・医療情報学
研究キーワード
深層学習
形態学
定量生物学
研究課題
深層生成モデルを用いた発生過程における形態定量化手法の開発2025-10 -- 2030-09堤真人武田科学振興財団/2025年度 医学系研究助成(基礎)2,000,000円
職歴
2025-12 -- (現在)名古屋大学大学院医学系研究科研究員
2024-10 -- 2025-11名古屋大学大学院医学系研究科特任助教
2023-10 -- 2024-09広島大学大学院統合生命科学研究科特任研究員
2020-04 -- 2023-03理化学研究所大学院生リサーチ・アソシエイト
学歴
2018-04 -- 2023-09東京大学 理学系研究科物理学専攻
2014-04 -- 2018-03東京大学 理学部 物理学科
取得学位
2023-09博士(理学)東京大学
所属学協会
2024-12 -- (現在)形の科学会
論文
  • Disentanglement of batch effects and biological signals across conditions in the single-cell transcriptome
    TSUTSUMI Masato
    Biorxiv, 2025-04
  • Deciphering the origin of developmental stability: The role of intracellular expression variability in evolutionary conservation
    堤 真人
    Evolution & Development, 2024-03
  • A deep learning approach for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape
    堤 真人
    NPJ Systems Biology and Applications, 2023-07-06
会議発表等
  • 機械学習を用いた生物形態の定量化とその応用について 霊長目の下顎骨を対象として
    堤 真人
    基礎生物学研究所部門セミナー/2021-10-01
  • A Deep learning approach for the shape analysis of the primates mandible
    堤 真人
    Euro Evo Devo/2022-06-01
  • A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape
    堤 真人
    第60回日本生物物理学会年会/2022-09-30
  • 機械学習を用いた様々な生物形態の定量化
    堤 真人
    広島大学数理生命科学プログラムセミナー/2022-11-10
  • 変分オートエンコーダを用いた霊長目の下顎形態特徴量抽出
    堤 真人
    定量生物学の会第十回年会/2022-12-15
  • Development of a quantitative analysis method for biological morphology using deep learning
    堤 真人
    Statphys28 Satellite meeting Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems/2023-08-08
  • 自由エネルギー原理を用いた脳内反芻思考の数理モデル
    堤 真人
    定量生物学の会 第十一回年会/2024-01-06
  • 深層学習を用いた 生物形態の定量解析手法の開発
    堤 真人
    第8回理論免疫学ワークショップ/2024-02-14
  • ベイズ推論を用いた脳内反芻思考の数理モデル
    堤 真人
    理論生物学スプリングスクール2024/2024-02-20
  • 深層学習を用いた 生物形態の定量解析手法の開発
    堤 真人
    シリーズオンラインセミナー「AIが切り開く進化生物学の未来」 第1回「画像認識AIで挑む! ⾏動・形態形質定量化のレベルアップ」/2024-03-09
  • 数理モデルを用いた社会的敗北ストレス下でのマウス行動の定量化
    堤 真人
    CPSY TOKYO 2024/2024-03-28
  • 深層学習による形態定量解析手法の提案
    堤 真人
    2024年度日本数理生物学会年会/2024-09-12
  • 深層学習による生物形態定量解析手法の開発
    堤 真人
    日本応用数理学会2024年度 年会/2024-09-16
  • エネルギーランドスケープ解析による 緊急事態宣言中/後における心理状態遷移の推定
    堤 真人
    SSTB2025 -Spring School for Theoretical Biology/2025-02-20
  • DOLO(Drosophila tracking with YOLO)による 2 重変異体ハエ幼虫の行動解析
    堤 真人
    第一回システム行動学研究会/2025-05-30
  • 3 次元 Variational Autoencoder を用いた形態変異の可視化
    堤 真人
    第 34 回日本バイオイメージング学会学術集会/2025-09-26
  • Development of a markerless multi-individual tracking system for controlling cannibalistic behavior in crickets
    堤 真人
    日本比較生理生化学会 第47回大会/2025-12-05
  • 深層学習を用いた形態定量化手法: Morpho-VAE
    堤 真人
    第99回形の科学シンポジウム「動きをもたらすかたち」/2025-11-30
知的財産権
  • バッチ効果の補正システム、制御プログラム、バッチ効果の補正方法
    堤 真人

(最終更新日: 2025-12-12)