Shoji Mitsuo

Affiliation
Center for Computational Sciences
Official title
Professor
URL
Email
58>3:54N]Y..>W?>@6@-,W,.W5;d
Office
Biophysics
Phone
029-853-6259
Research fields
Biological physics/Chemical physics/Soft matter physics
Basic chemistry
Research keywords
Quantum Chemistry
QM/MM
酵素反応
反応機構の理論解明
生物無機化学
多核金属錯体
Molecular Dynamics
分子磁性
Research projects
生体内量子多体系における特異的化学反応の機構解明2019-10 -- 2023-03庄司光男JST/JST-PRESTO40,000,000Yen
自然・半導体・分子触媒で利用可能な多様な水分解反応機構の解明2020-04 -- 2022-03庄司光男日本学術振興会/新学術領域研究(研究領域提案型)3,900,000Yen
光化学系II酸素発生中心における再活性化機構についての理論的解明2018-04 -- 2020-03庄司 光男Japan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas5,200,000Yen
光化学系II酸素発生中心における水分解反応の全反応経路解明2017-04 -- 2020-03庄司 光男Japan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists(A)25,870,000Yen
トレオニン合成酵素の全反応機構の理論的解明2014-04 -- 2017-03庄司 光男Japan Society for the Promotion of Science/基盤研究(C)5,070,000Yen
生体酵素における反応機構と反応制御機構解明のための理論的研究2012-04 -- 2014-03庄司光男Japan Society of for the Promotion of Science/若手研究(B)3,770,000Yen
Career history
2023-10 -- (current)筑波大学計算科学研究センター教授
2019-10 -- 2023-03JSTPRESTO研究員(兼任)
2016-04 -- 2023-09筑波大学計算科学研究センター助教
2011-10 -- 2016-03筑波大学数理物質系助教
2010-07 -- 2011-09筑波大学数理物質科学研究科助教
2008-04 -- 2010-06日本学術振興会特別研究員(PD)
2007-04 -- 2008-03日本学術振興会特別研究員(PD)
2006-04 -- 2007-03日本学術振興会特別研究員(DC2)
Academic background
-- 2007-03大阪大学 理学研究科 博士課程
Degree
2007-03博士(理学)大阪大学
Academic societies
2018 -- (current)The Molecular Simulation Society of Japan
2014 -- (current)理論化学研究会
2012 -- 2021-03PROTEIN SCIENCE SOCIETY OF JAPAN
2011 -- (current)THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
2011 -- 2021-03The Japanese Biochemical Society
2005 -- 2021-03Society of Computer Chemistry, Japan
2002 -- (current)Chemical Society of Japan
Honors & Awards
2023-05量子生命科学会 研究奨励賞量子生命科学に関連する研究において顕著な業績を挙げた
2022-05Best Presentation優れた研究内容について講演を行なったため
2021-09Best Presentationfor a presentation of eminent research
2020-12量子生命科学会 第二回大会 優秀発表賞優れた学術研究発表を行ったため
Articles
Books
Conference, etc.
  • 星間空間におけるホモキラリティー発生の理論的研究
    堀 優太; 渡辺 七都稀; 庄司 光男; 重田 育照
    第17回分子科学討論会/2023-09-12--2023-09-15
  • ヘモグロビンM IwateとM BostonのFe-O伸縮振動の理論計算の改良およびヘモグロビンAとの構造の比較
    長友重紀; 寺田拓人; 庄司光男; 重田育照; 中谷清治; 廣田俊; 柳澤幸子; 久保稔; 北川禎三; 長井雅子; 大木規央; 朴三用; ...
    第49回生体分子科学討論会/2023-06-01--2023-06-02
  • 酵素反応のQM/MM解析
    Shoji Mitsuo
    スーパーコンピュータワークショップ2022「複雑電子状態の理論・計算科学」/2023-01-17--2023-01-17
  • Unique reaction mechanism of copper amine oxidase revealed by theoretical QM/MM and experimental approaches
    Shoji Mitsuo
    CCS-KISTI workshop/2023-02-22--2023-02-22
  • A Large Conformational Change of the Quinone Cofactor in Bacterial Copper Amine Oxidase
    Shoji Mitsuo
    ICPAC Kota Kinabalu 2022/2022-11-25--2022-11-25
  • 酵素反応における構造変化の重要性
    Shoji Mitsuo
    令和4年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム/2022-11-21--2022-11-21
  • アミノ酸ホモキラリティ起源についての電子状態探査
    Shoji Mitsuo
    計算アストロバイオロジー2022/2022-11-10--2022-11-10
  • QM/MM-MD study of the role of valine 185 in the oxygen-evolving complex of photosystem II
    Shoji Mitsuo
    60th Annual Meeting of BSJ/2022-09-30--2022-09-30
  • Natural selection of the Mn cluster in the photosynthetic water oxidation
    Shoji Mitsuo
    Satellite Meeting to 18th International Congress on Photosynthesis Research (WOX-ICPR2022)/2022-08-07--2022-08-07
  • GLASアルゴリズムによる酵素反応機構の理論解明:新規反応経路探索手法の開発と適用
    Shoji Mitsuo
    物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線:理論と実験との密な協働」/2022-07-27--2022-07-27
  • 銅含有アミン酸化酵素におけるトパキノン補酵素の構造変化機構
    Shoji Mitsuo
    第22回日本蛋白質科学会年会/2022-06-08--2022-06-08
  • 銅含有アミン酸化酵素におけるトパキノン補酵素の構造変化機構
    Shoji Mitsuo
    第22回日本蛋白質科学会年会/2022-06-08--2022-06-08
  • 光合成水分解酸素発生におけるMnの自然選択の理由
    Shoji Mitsuo
    量子生命科学会第4回大会/2022-05-26--2022-05-26
  • Theoretical insights into the molecular mechanisms of dynamical biochemical reactions
    Shoji Mitsuo
    Molecular Movies International Symposium 2022/2022-05-13--2022-05-13
  • 有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究
    渡辺 七都稀; 庄司 光男; 堀 優太; 重田 育照
    日本コンピュータ化学会2022年秋季年会/2022-11-25--2022-11-27
  • heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality
    堀 優太; 渡辺 七都稀; 庄司光男; 重田 育照
    Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022/2022-11-29--2022-12-02
  • Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization
    渡辺 七都稀; 庄司光男; 堀 優太; 重田 育照
    Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022/2022-11-29--2022-12-02
  • 銅アミン酸化酵素におけるドパキノン補酵素のコンフォメーション制御機構
    Shoji Mitsuo
    量子生命科学先端フォーラム2021冬の研究会/2021-12
  • 銅含有アミン酸化酵素におけるセミキノンラジカル生成機構の理論解明
    Shoji Mitsuo
    I4LEC 第4回公開シンポジウム/2021-09
  • 自然・半導体・分子触媒で利用可能な多様な水分解反応機構の解明
    Shoji Mitsuo
    I4LEC 第4回公開シンポジウム/2022-03
  • QM/MM study of the large conformational change of quinone cofactor during the catalytic cycle of bacterial copper amine oxidases
    Shoji Mitsuo
    2022 LBNL/CSA - Tsukuba/CCS Collaboration Meeting/2022-03
  • 結晶成長によるアミノ酸キラル増幅に関する理論的研究
    渡辺 七都稀; 庄司 光男; 堀 優太; 重田 育照
    日本コンピュータ化学会2021年秋季年会/2021-11-2--2021-11-3
  • GLAS 法による分子構造及び化学反応経路の探索
    庄司 光男
    日本コンピュータ化学会2021年秋季年会/2021-11-02--2021-11-02
  • 銅含有アミン酸化酵素におけるセミキノンラジカル生成機構の理論解明
    庄司 光男
    量子生命科学会第3回大会/2021-09-16--2021-09-16
  • 銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についてのQM/MM解析
    庄司 光男
    第47回生体分子科学討論会/2021-06-04--2021-06-04
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Teaching
2023-04 -- 2023-08Collaborative Research in Physics IVUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Collaborative Research in Physics IVUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Collaborative Research in Physics VUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Collaborative Research in Physics VUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Special seminar for condensed matter theory VAUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Seminar on Theoretical Condensed Matter Physics DUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Special seminar for condensed matter theory IIIBUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Special seminar for condensed matter theory VBUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Practical Training in Physics IUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Practical Training in Physics IUniversity of Tsukuba.
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Talks
  • 構造探索手法(GLAS)による酵素反応機構の解明
    庄司 光男
    SRPS2020/2020-9-13--2020-9-13
  • サルコシンオキシダーゼにおけるシクロプロピルグリシンの反応機構についての理論的解明
    庄司 光男
    第93回日本生化学学会年会/2020-9-14--2020-9-14
  • Recent Progress in the Reaction Mechanism of Water-Splitting in Photosystem II
    Shoji Mitsuo
    70th JSCC/2020-9-28--2020-9-28
  • QM/MMで見えてきた酵素反応の特徴
    庄司 光男
    高速分子動画領域会議/2020-10-20--2020-10-20
  • 銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についてのQM/MM解析
    庄司 光男
    量子生命科学会第2回大会/2020-12-23--2020-12-23
Professional activities
2023-10 -- 2025-10Japan Society for Theoretical Chemistry幹事
2020-04 -- 2021-03Japan Society for Theoretical Chemistry将来構想委員
2019-04 -- 2022-03The Molecular Simulation Society of Japanアンサンブル編集委員

(Last updated: 2023-10-05)