Shiba Kogiku

Affiliation
Institute of Life and Environmental Sciences
Official title
Assistant Professor
URL
Email
/<@8:<FTc_D9:>@52]EDF<F32]24];AjD9:32]<@8:<F]<2Tc_F]EDF<F32]24];A
Phone
0558-22-1317
Research fields
Cell biology
Animal physiology/Animal behavior
Research keywords
sperm
flagella
cilia
sperm motility analysis
fertilization
motor protein
ascidian
sea urchin
Research projects
精子走化性における鞭毛運動制御機構の解明2020-09 -- 2021-07柴小菊/公益信託成茂動物科学振興基金600,000Yen
精子鞭毛波形制御におけるカルシウムイオンとcAMPの役割の解明2019 -- 2021柴 小菊Japan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research(C)4,420,000Yen
精子鞭毛波形制御におけるカルシウムイオンとcAMPの役割の解明2019-04 -- 2022-03柴　小菊独立行政法人　日本学術振興会/基盤研究(C)4,420,000Yen
プロテオミクスと分子イメージングの融合による精子鞭毛運動制御因子の解析2016 -- 2018柴 小菊Japan Society for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research(C)4,940,000Yen
精子機能を調節する時空間的な細胞内カルシウムシグナルの可視化2014 -- 2015柴　小菊Japan Society for the Promotion of Science/若手研究(B)4,030,000Yen
卵因子が制御する精子細胞内シグナルの可視化2010 -- 2011Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology, Japan/新学術領域研究6,620,000Yen
カルシウムシグナルを介した鞭毛・繊毛運動制御機構の解明2009 -- 2010Japan Society of for the Promotion of Science/若手研究(B)1,560,000Yen
Career history
2005-04 -- 2008-03University of TokyoMisaki Marine Biological StationPostdoctoral Fellow
2008-04 -- 2009-03University of TokyoMisaki Marine Biological StationPostdoctoral Fellow
2009-04 -- 2009-06University of TsukubaShimoda Marine Research CenterPostdoctoral Fellow
2009-07 -- (current)University of TsukubaShimoda Marine Research CenterAssistant Professor
Academic background
1996-04 -- 2000-03Ochanomizu University Faculty of Science Department of Biology
2000-04 -- 2005-03Ochanomizu University 人間文化研究科 人間環境科学専攻
Degree
2005-03博士(理学)Ochanomizu University
Academic societies
2018-03 -- (current)The Molecular Biology Society of Japan
2008 -- (current)THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
2001 -- (current)THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN
Honors & Awards
2018-12日本動物学会奨励賞
2017-02お茶の水女子大学賞：第1回 保井コノ賞
2016-06第18回守田科学研究奨励賞
2014-08Best Presentation Award
2010-0611th International Symposium on Spermatology,Best Poster Award
Articles
Books
  • Sperm guidance: comparison with motility regulation in bikont species.
    Shiba Kogiku
    Flagellar Mechanics and Sperm Guidance/Bentham Science Publishers/pp.349-389, 2015-11
  • Molecular comparison of the axonemal components between sperm flagella and Chlamydomonas flagella.
    Shiba Kogiku; Mizuno Katsutoshi; Inaba Kazuo
    Sperm Cell Research in the 21st Century: Historical Discoveries to New Horizons./Adthree Publishing Co. Ltd./pp.30-40, 2012-08
  • Modification of flagellar movement by sperm-activating　peptides in echinoderms
    柴 小菊
    2005-03
Conference, etc.
  • 精子が卵に近づく運動メカニズム
    柴 小菊
    第45回エアロ・アクアバイオメカニズム学会講演会/2022-03-22
  • ジオラマ環境下での精子走化性の応答計測に向けて
    柴 小菊
    科学研究費助成事業 学術変革領域研究（A）「ジオラマ環境で覚醒する原生知能を定式化する細胞行動力学」 シンポジウム/2022-03-10
  • 3D 遊泳トラッキングシステムを用いたホヤ精子走化性の解析
    柴 小菊; 稲葉 一男
    2022 年生体運動研究合同班会議/2022-01-07--2022-01-09
  • The role of CNG channel in the regulation of flagellar motility in the ascidian sperm
    Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The virtual Dynein 2021 International Workshop/2021-09-08--2021-09-09
  • The role of CNG channel in the regulation of flagellar motility in the ascidian sperm
    柴 小菊; 稲葉 一男
    第92回日本動物学会オンライン米子大会/2021-09-02--2021-09-04
  • The role of Ca2+ in the regulation of flagellar movement during sperm chemotaxis
    Shiba Kogiku
    RIMS Workshop “Biofluid Mechanics of Reproduction” in Biofluids 2021/2021-07-29--2021-07-30
  • Change in the Helical Symmetry of Chlamydomonas and Ciona Flagellar Axonemes Coupled with the Change in Ca2+ Concentrations Revealed by X-ray Fiber Diffraction
    Oiwa Kazuhiro; Iwamoto Hiroyuki; Shiba Kogiku; Inaba ...
    64th Annual Meeting of the Biophysical-Society/2020-02-15--2020-02-19
  • Genome analysis of a symbiotic nitrogen-fixing cyanobaterium in a pelagic dinoflagellate, Histioneis depressa.
    Nakayama Takuro; Nomura Mami; Takano Yoshihito; Shiba Ko...
    VIII European Congress of Protistology/2019-07-28--2019-08-02
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    柴 小菊; 坂野 太一; 古田 寿昭; 藤原 英史; 馬場 昭次; 稲葉 一男
    第56回日本生物物理学会年会/2018-09-15--2018-09-17
  • Calaxin is essential for ciliary formation in nodal monocilia but not in sperm flagella or epithelial multicilia
    Kazuo Inaba; Kogiku Shiba; Natsuko Kawano Yuhkoh Satouh ...
    XIII International Symposium on Spermatology (ISS)/2018-05-09--2018-05-13
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    Kogiku Shiba; Taichi Sakano Toshiaki Furuta Eiji Fujiwa...
    XIII International Symposium on Spermatology (ISS)/2018-05-09--2018-05-13
  • Function of NCS family protein calaxin in the regulation of sperm flagellar waveform
    Mizuno Katsutoshi; Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan/2009-10-30--2009-11-01
  • cAMP modulates Ca2+-mediated regulation of sperm flagellar waveform
    Shiba Kogiku; Sakano Taichi; Furuta Toshiaki; Fujiwara E...
    International Workshop Dynein 2017/2017-10-29--2017-11-01
  • 精子走化性時の鞭毛波形制御におけるcAMPの役割
    柴 小菊; 坂野太一; 古田寿昭; 藤原英史; 馬場昭次; 稲葉一男
    生体運動研究合同班会議/2018-01-05--2018-01-07
  • 炭酸脱水酵素/CO2 を介したカレイ類系統特異的な精子運動阻害
    佐野 マリコ; 柴 小菊; 稲葉 一男
    日本動物学会第86回大会/2015-9-17--2015-9-19
  • A novel subunit of axonemal dynein contains a photoreceptor protein domain
    Kutomi Osamu; Keiko Hirose; Mizuno Katsutoshi; Shiba Kogi...
    17th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas/2016-06-26--2016-07-01
  • カルシウムイオンを介した精子鞭毛波形制御におけるcAMP の調整作用
    柴 小菊; 坂野 太一; 古田 寿昭; 藤原 英史; 馬場 昭次; 稲葉 一男
    日本動物学会第88回大会/2017-09-21--2017-09-23
  • Roles of calcium in the regulation of sperm flagellar movement
    Shiba Kogiku
    フランスビルフランシュ臨海実験所セミナー/2017-07-01
  • Roles of calcium in the regulation of sperm flagellar movement
    Shiba Kogiku
    第54回日本生物物理学会年会シンポジウム“運動性鞭毛・繊毛の最前線 －生体ナノマシンの制御機構－”/2016-11-25--2016-11-25
  • Regulation of asymmetry in sperm flagellar waveforms and intracellular calcium.
    Shiba Kogiku
    “Cilia: their coordination in motility, morphogenesis and eukaryotic evolution”, The joint meeting of the 22nd International Congress of Zoology and the 87th Meeting of the Zoological Society of Japan/2016-11-15--2016-11-15
  • The role of soluble adenylyl cyclase in the regulation of flagellar motility in Ciona sperm
    Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The 8th International Tunicate Meeting/2015-07-13--2015-07-17
  • ホヤ精子における可溶性アデニル酸シクラーゼの役割
    Shiba Kogiku; Kazuo Inaba
    日本動物学会第85回大会/2014-09-11--2014-09-13
  • The role of soluble adenylyl cyclase in the regulation of flagellar motility in Ciona sperm.
    Shiba Kogiku; Inaba Kazuo
    The 12th International Symposium on Spermatology/2014-08-08--2014-08-10
  • Comparative analysis of flagellar motility of chytrid zoospores and metazoan sperm
    Shiba Kogiku; Seto Kensuke; Degawa Yousuke; Inaba Kazuo
    International Workshop Dynein 2013/2013-10-31--2013-11-3
  • 鞭毛非対称波の伝播におけるカラクシンの役割
    柴 小菊; 馬場昭次; 藤原英史; 稲葉一男
    生体運動研究合同班会議/2016-1-8--2016-1-10
Teaching
2024-03 -- 2024-03Marine Molecular Biology IIUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Seminar on Molecular and Cellular Biology IIFUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Seminar on Molecular and Cellular Biology IVSUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2023-12Introduction to Molecular and Cellular BiologyUniversity of Tsukuba.
2023-08 -- 2023-08Reproductive Biology IUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2023-12Marine Biology IIUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Methodology on Molecular and Cellular Biology ISUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Thesis Research in Molecular and Cellular Biology FUniversity of Tsukuba.
2023-10 -- 2024-02Seminar on Molecular and Cellular Biology VFUniversity of Tsukuba.
2023-04 -- 2023-08Methodology on Molecular and Cellular Biology IISUniversity of Tsukuba.
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Other educational activities
2017-04 -- 2018-03非常勤講師お茶の水女子大学理学部
2013-04 -- 2013-09非常勤講師山形大学理学部
2010-01 -- 2010-03非常勤講師お茶の水女子大学理学部
Talks
  • 海の中のミクロの世界 － 鞭毛と繊毛
    柴 小菊
    第11回女子中高生のための先端科学セミナー「海にいこうよ －サイエンスの宝庫へ－」/2021-05-16--2021-05-16
  • 海の中のミクロの世界－鞭毛と繊毛
    柴 小菊
    第7回リケジョ・未来シンポジウム/2017-09-17
  • カタユウレイボヤ精子走化性時における鞭毛運動調節機構
    柴 小菊; 馬場昭次; 吉田学
    第38回精子談話会/2007-01-13
  • カタユウレイボヤ精子走化性機構の解析.
    柴 小菊; 馬場昭次; 吉田学
    第21回エアロ・アクアバイオメカニズム研究会/2008-03-21
  • 海産無脊椎動物精子を用いた鞭毛運動制御機構の解析
    柴 小菊; 稲葉一男
    第63回日本細胞生物学会大会サテライトシンポジウム「繊毛研究のニューフロンティア －構造から機能そして病態へ－」/2011-06-29
  • 「海の中のミクロの世界～鞭毛と繊毛」
    柴 小菊
    動物学会（関東支部）企画ビデオ講演会： - 動画で見る海の生物の世界 -/2011-11-19
Professional activities
2020-09 -- 2022-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN理事
2018-09 -- 2020-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN関東支部委員
2015-03 -- 2021-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPANZDW(ZooDiversityWeb)委員会
2013-03 -- 2021-09THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN男女共同参画委員会
2012-10 -- 2013-09男女共同参画学協会連絡会第11期男女共同参画学協会連絡会運営委員
University Management
2010-04 -- 2021-03下田臨海実験センター運営委員

(Last updated: 2022-08-17)