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YING BEIWEN(イン ベイウェン; YING, BEIWEN)

所属
生命環境系
職名
准教授
性別
女性
URL
電話
029-853-6633
Fax
029-853-6633
研究分野
システムゲノム科学
進化生物学
生態・環境
計算科学
生命・健康・医療情報学
研究キーワード
細胞増殖
ゲノム縮小
実験進化
遺伝子発現
細胞培養
機械学習
バイオインフォマティクス
研究課題
細胞培養のデータ駆動型最適化の基盤技術の開発2021 -- 2023YING BEIWEN日本学術振興会/挑戦的研究（萌芽）6,370,000円
ラクトバチルス菌検査キットの培養速度の向上2021 -- 2022BEIWEN YING民間企業/共同研究5,280,000円
細胞培養（培地）の最適化プラットフォームの開発2020 -- 2021YING BEIWEN文部科学省 (つくばグローバル・イノベーション推進機構)/地域イノベーション・エコシステム形成プログラム3,520,000円
ゲノム縮小と増殖速度の相関の機構解明2019 -- 2022YING　BEIWEN日本学術振興会/基盤研究(B)13,650,000円
人工的遺伝子回路の発現レベルの予測モデルの構築2014 -- 2015YING　BEIWEN日本学術振興会/新学術領域研究（研究領域提案型）4,420,000円
極限貧栄養環境下で増殖する細胞の創出2014 -- 2016YING　BEIWEN日本学術振興会/基盤研究(C)5,070,000円
大腸菌の確率的環境適応応答の解析2014-04 -- 2015-03イン　ベイウェン科学技術振興機構(JST)/共同研究
細胞増殖に伴う集団秩序の維持2013-04 -- 2015-03イン　ベイウェン日本学術振興会/科研費補助金　新学術領域研究（公募研究）
大腸菌ゲノム高温適応進化機構の解明2011-04 -- 2014-03四方哲也日本学術振興会/科学研究費補助金　基盤研究(A)
単細胞を用いた細胞分化の恒常性モデルの構築2010-04 -- 2012-03イン　ベイウェン日本学術振興会/科学研究費補助金　萌芽研究
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職歴
2013 -- (現在)筑波大学 准教授
2007 -- 2013大阪大学 助教、特任准教授
2006 -- 2007フランス国立科学研究センター 研究員
2005 -- 2006東京大学 リサーチフェロ―
学歴
2000 -- 2005東京大学 新領域創成科学研究科修了
取得学位
2005-03博士（生命科学）東京大学
所属学協会
2018 -- (現在)日本農芸化学会
2017 -- (現在)米国微生物学会
2015 -- (現在)日本微生物生態学会
2007 -- (現在)日本ゲノム微生物学会
論文
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著書
  • Comparative analyses of bacterial transcriptome reorganisation in response to temperature increase.
    YING BEIWEN; YOMO Tetsuya
    Stress and Environmental Regulation of Gene Expression and Adaptation in Bacteria, 2016-05
  • Built-in synthetic gene circuits in Escherichia coli – methodology and applications.
    YING BEIWEN; YOMO Tetsuya
    Advances in Applied Biotechnology, 2012-01
  • Protein generation using a reconstituted system.
    YING BEIWEN; UEDA Takuya
    Protein Engineering Handbook, 2009-01
  • The PURE system: a minimal cell-free translation system.
    YING BEIWEN; SHIMIZU Yoshihiro; UEDA Takuya
    Cell-Free Expression, 2007-12
会議発表等
  • 微生物集団増殖に優位的に影響する環境因子の探索
    會田　穂乃香; 橋詰　崇雅; YING BEIWEN
    日本微生物生態学会第34回大会/2021-10-30--2021-11-2
  • 大腸菌コロニー形成の空間分布の解析
    人見　健矢; YING BEIWEN
    日本微生物生態学会第34回大会/2021-10-30--2021-11-2
  • 大腸菌ゲノム縮小に伴う変異率と増殖速度の協調的変化
    黒川　真臣; 西村　一成; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第15回大会/2021-03-04--2021-03-06
  • 大腸菌遺伝子発現のゲノム周期性と増殖速度の相関
    永井　元基; 黒川　真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第15回大会/2021-03-04--2021-03-06
  • 大腸菌コロニー形成パターンの解析
    XUE Heng; YING BEIWEN
    日本微生物生態学会第33回大会/2019-09-10--2019-09-13
  • 遺伝子発現のゲノム周期性に関する検証
    永井　元基; 黒川　真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第14回大会/2020-03-06--2020-03-08
  • 大腸菌ゲノム縮小株ライブラリーの網羅的実験進化
    黒川　真臣; 永井　元基; 瀬尾　茂人; 小椋　義俊; 林　哲也;...
    日本ゲノム微生物学会第14回大会/2020-03-06--2020-03-08
  • 微生物培養のデータ駆動型最適化
    YING BEIWEN; 會田　穂乃香; 内田　圭祐; 芦野　一葉; 天笠　...
    日本ゲノム微生物学会第14回大会/2020-03-06--2020-03-08
  • 機械学習を用いた集団増殖における環境因子の貢献度分析
    YING BEIWEN
    Future Trend in Polymer Science 2018 (FTiPS2018)/2019-03-20--2019-03-20
  • 大腸菌増殖における培地成分の寄与度の学習分析
    YING BEIWEN; 芦野一葉; 菅野健太; 天笠俊之
    日本農芸化学会2019年東京大会/2019-03-24--2019-03-24
  • 微生物の物質生産に適した化学環境条件の網羅的探索
    内田圭裕; 桝尾俊介; 高谷直樹; YING BEIWEN
    超異分野学会2019/2019-03-08--2019-03-08
  • 大腸菌の増殖を決定する環境要因の判定と予測
    芦野一葉; 菅野健太; 天笠　俊之; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第13回大会/2019-03-07--2019-03-07
  • 変異による適応度貢献のゲノム縮小に伴う増加
    黒川真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第13回大会/2019-03-06--2019-03-06
  • 機械学習を用いた集団増殖における環境因子の貢献度分析
    YING BEIWEN; 芦野一葉; 菅野健太; 天笠俊之
    日本分子生物学会第41回大会/2018-11-28--2018-11-30
  • 大腸菌における非必須遺伝子と増殖速度の関係
    劉柳; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第12回大会/2018-03-05--2018-03-07
  • ゲノム縮小と大腸菌増殖の相関
    黒川真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第12回大会/2018-03-05--2018-03-07
  • ヒスチジン枯渇環境に適応した大腸菌に対する解析
    日原奨希; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第12回大会/2018-03-05--2018-03-07
  • 大腸菌広域欠失株の増殖に対する数理的評価
    黒川真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第10回大会/2016-03-04
  • ヒスチジン枯渇を長期間経験したヒスチジン要求性大腸菌株に対する解析
    日原奨希; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第11回大会/2017-03-02--2017-03-04
  • 大腸菌ゲノム縮小株の増殖に対する研究
    黒川真臣; YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第11回大会/2017-03-02--2017-03-04
  • 大腸菌ゲノム縮小における増殖速度と変異率の相関
    YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第11回大会/2017-03-02--2017-03-04
  • Connecting bacterial growth with genome and transcriptome.
    YING BEIWEN
    International workshop on "Integration of Synthetic Biology and Systems Biology of Microbes"/2016-03-17
  • An evolutionary trade-off between growth and sustainability accompanied by ribosomal damages
    YING BEIWEN
    日本ゲノム微生物学会第10回大会/2016-03-04
  • 実験室内進化から見えた大腸菌の生き残り戦略
    YING BEIWEN
    日本バイオインフォマティクス学会・平成27年度生命システム理論研究会/2015-11-27
  • 実験室内極限生物の創出
    YING BEIWEN
    日本宇宙生物科学会第28回大会/2014-09-22
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知的財産権
  • 培養環境判定装置、培養環境判定方法、及びプログラム
    YING BEIWEN; Amagasa Toshiyuki
  • リボソームディスプレイ
    UEDA Takuya; OHASHI Hiroyuki; SHIMIZU Yoshihiro; YING BEI...
担当授業科目
2021-10 -- 2022-02環境バイオマス共生学インターンシップ筑波大学
2021-04 -- 2021-08環境バイオマス共生学インターンシップ筑波大学
2021-10 -- 2022-02環境バイオマス共生学セミナーD筑波大学
2021-04 -- 2021-08環境バイオマス共生学セミナーD筑波大学
2021-10 -- 2022-02環境分子微生物学研究法筑波大学
2021-04 -- 2021-08環境分子微生物学研究法筑波大学
2021-07 -- 2021-08グリーンバイオ微生物概論筑波大学
2021-04 -- 2021-08環境バイオマス共生学セミナーA筑波大学
2021-10 -- 2022-02環境バイオマス共生学セミナーA筑波大学
2021-10 -- 2022-02負荷適応微生物学講究II筑波大学
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授業以外の教育活動
2017-04 -- 2017-04キャリアデザインワークショップ東京大学
一般講演
  • Experimental evolution with laboratory E. coli strains
    YING BEIWEN
    華東理工大学　セミナー/2017-03-20
  • Stochastic Adaptation and Thermal Adaptive Evolution
    YING BEIWEN
    中国農業大学　セミナー/2011-11-01
  • 実験室内進化からみた大腸菌の高温適応進化
    YING BEIWEN
    「酵母リソース工学」開設式・記念講演会/2011-11-29
学協会等委員
2020 -- (現在)BMC MicrobiologyEditorial Board Member
2019 -- (現在)Scientific reports (Nature Publishing Group)Editorial Board Member
2018 -- (現在)Frontiers in MicrobiologyReview Editor
2015 -- (現在)日本ゲノム微生物学会評議員
学内管理運営業績
2019-04 -- (現在)教務委員会（学位プログラム）委員
2017-04 -- (現在)ダイバーシティ・アクセシビリティ（専攻）
2015-04 -- (現在)学生支援（専攻）委員

(最終更新日: 2021-12-15)