現在地

尾崎 遼(オザキ ハルカ; Ozaki, Haruka)

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所属
医学医療系
職名
准教授
ORCID
0000-0002-1606-2762
URL
eメール
 
研究分野
生命・健康・医療情報学
システムゲノム科学
研究キーワード
情報生命科学
バイオインフォマティクス
研究自動化
研究課題
アレルゲン免疫療法のシングルセルおよびbulk遺伝子発現情報による病態解明2019-04 -- 2022-03野口 恵美子日本学術振興会/基盤研究(B)17,420,000円
iPS細胞から作成される立体網膜の出来のバラツキに関する研究2019-03 -- 2021-05高橋政代独立行政法人 理化学研究所/共同研究経費1,150,000円
大人数の遺伝子発現データ無しで表現型と遺伝子発現の個人差の関連を調べる手法の開発2019 -- 2021尾崎 遼日本学術振興会/若手研究4,030,000円
職歴
2018-06 -- (現在)筑波大学 人工知能科学センター
2018-06 -- (現在)筑波大学 医学医療系 生命科学域 バイオインフォマティクス分野 准教授
2018-04 -- 2018-05理化学研究所 生命機能科学研究センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 基礎科学特別研究員
2016-04 -- 2018-03理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 基礎科学特別研究員
2015-04 -- 2016-03理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 特別研究員
学歴
2012-04 -- 2015-03東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 博士後期課程修了
2010-04 -- 2012-03東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 修士課程修了
2006-04 -- 2010-03東京大学 理学部 生物化学科卒業
取得学位
2015-03博士(科学)東京大学
所属学協会
-- (現在)日本バイオインフォマティクス学会
査読付き学術雑誌・国際会議論文
その他の論文・記事
著書
  • 0 から始めるエピゲノム解析(ChIP-seq)ver2
    尾崎 遼
    次世代シークエンサーDRY解析教本 改訂第2版, 学研メディカル秀潤社, 2019-12
会議発表等
  • シングルセルオミクスにおけるデータサイエンス
    尾崎 遼
    日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 第四回講演会 ~細胞工学分野におけるデータサイエンス~/2021-03-17--2021-03-17
  • シングルセルRNAシーケンス解析から考える環境DNA研究
    尾崎 遼
    環境DNA・環境RNA研究の新たな挑戦/2020-12-15--2020-12-15
  • シングルセル解析の射程とウイルス研究
    尾崎 遼
    第43回日本分子生物学会年会(MBSJ2020)/2020-12-02--2020-12-04
  • Millefy: visualizing cell-to-cell heterogeneity in read coverage of single-cell RNA sequencing datasets
    尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • NGS データ解析のワークフロー記述と研究自動化への展望
    尾崎 遼
    CBI学会 2020大会/2020-10-27--2020-10-29
  • NGSデータ解析のワークフロー記述とロボット実験への応用
    尾崎 遼
    Laboratory Automation Developers Conference 2020 (LADEC2020)/2020-10-03
  • ChIP-Atlas の二次解析による多彩な転写因子認識配列の解明および更なるデータベース化
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    トーゴーの日 シンポジウム 2020/2020-10-06--2020-10-06
  • 機械学習を用いたRNA安定性予測モデルの開発
    服部 恵美; 土屋 貴穂; 脇田 寛泰; 川田 健太郎; 山地 雄大; ...
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • CellCellTopic: cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • ChIP-seqデータベースの大規模解析で解明する細胞型ごとに多彩な転写因子認識配列
    田原 沙絵子†; 土屋 貴穂†; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • ChIP-seqデータベースの大規模解析で解明する細胞型ごとに多彩な転写因子認識配列
    田原 沙絵子†; 土屋 貴穂†; 尾崎 遼
    生命情報科学若手の会 第12回 研究会/2020-08-27--2020-08-28
  • Millefy によるリードカバレージの細胞間不均一性の可視化
    尾崎 遼
    シングルセルゲノミクス研究会2019/2019-08-29--2019-08-30
  • シングルセル空間トランスクリプトームデータを用いた遺伝子制御ネットワークの空間分布解析
    土屋 貴穂; 尾崎遼
    第8回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2019)/2019-09-09--2019-09-11
  • (サイトメトリー研究者のための)1細胞オミクス計測データ解析のフロンティア
    尾崎 遼
    第28回日本サイトメトリー学会学術集会/2018-05-27--2018-05-27
  • Inferring activity and targets of enhancers in single cells through single-cell enhancer RNA analyses
    Ozaki Haruka
    International Workshop for Systems Genetics 2018/2018-11-19--2018-11-19
  • シングルセルRNAシーケンス解析から考える環境DNA研究の展望
    尾崎 遼
    日本生態学会 第66回大会/2019-03-19--2019-03-19
作品
  • https://github.com/rikenbit/ramdaq
    Ozaki Haruka
  • ReadCoverage.jl
    Ozaki Haruka
  • Millefy: Genome browser-like visualization of single-cell RNA-seq dataset
    Ozaki Haruka
担当授業科目
2021-10 -- 2022-02ゲノム環境医学特論II筑波大学
2021-04 -- 2021-08ゲノム環境医学特論I筑波大学
2021-04 -- 2021-08ヒューマンバイオロジー研究II筑波大学
2021-10 -- 2022-02ヒューマンバイオロジー研究II筑波大学
2021-04 -- 2021-08ゲノム環境医学実験実習I筑波大学
2021-07 -- 2021-08バイオインフォマティクス筑波大学
2022-01 -- 2022-01バイオインフォマティクス筑波大学
2021-10 -- 2022-02ゲノム環境医学実験実習II筑波大学
2021-10 -- 2022-02ゲノム環境医学演習II筑波大学
2021-04 -- 2021-08ゲノム環境医学演習I筑波大学
学協会等委員
2021-04 -- (現在)日本バイオインフォマティクス学会幹事(JSBi Bioinformatics Review)
2020-04 -- (現在)日本バイオインフォマティクス学会幹事(ニュースレター)
2019-04 -- 2023-03日本バイオインフォマティクス学会理事

(最終更新日: 2021-09-05)