Tsuchiya Takaho

Affiliation
Faculty of Medicine
Official title
Assistant Professor
ORCID
0000-0001-7540-5115
KAKEN ID
70853167
URL
Email
I+v"v}&C+*,x} 0v:IE$yC+*,",wvCvxC!'
Office
Bioinformatics Laboratory
Research fields
Life / Health / Medical informatics
System genome science
Research keywords
情報生命科学
Systems Biology
Bioinformatics
Research projects
2型糖尿病の代謝アダプテーション(研究分担者)2020-04 -- 2022-03黒田真也Japan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas5,818,337Yen
1細胞空間トランスクリプトームによる細胞内と細胞間の統合ネットワーク推定手法開発2020-04 -- 2023-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Young Scientists4,160,000Yen
集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計法の確立2019-08 -- 2021-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for Research Activity start-up2,860,000Yen
集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計手法の確立2019-08 -- 2020-03Takaho TsuchiyaUniversity of Tsukuba/Tsukuba Basic Research Support Program Type S1,000,000Yen
シグナル伝達の時間パターンから解明するリガンド選択的な遺伝子発現機構2014-04 -- 2017-03Takaho TsuchiyaJapan Society of for the Promotion of Science/Grant-in-Aid for JSPS Fellows3,200,000Yen
Career history
2019-05 -- (current)University of TsukubaCenter for Artificial Intelligence Research
2019-05 -- (current)University of Tsukuba医学医療系 生命医科学域 バイオインフォマティクス研究室Assistant Professor
2017-04 -- 2019-03Astellas Pharma Inc.Associate
2014-04 -- 2017-03Japan Society for the Promotion of ScienceResearch Fellow (DC1)
Academic background
2014-04 -- 2017-03University of Tokyo Faculty of Science Department of Biological Sciences
2012-04 -- 2014-03University of Tokyo Faculty of Science Department of Biophysics & Biochemistry
2007-04 -- 2012-03Kyoto University Faculty of Science
Degree
2018-03Ph.D.
Licenses and qualifications
2020-09第1回 医学教育ワークショップ(医学類教育初任者研修)修了
2019-02日本メディカルAI学会公認資格 機械学習・深層学習基礎コース / メディカルAI専門コース修了
2014-12日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)認定技術者
2014-08東京大学Future Faculty Program(Faculty Development)修了
Academic societies
-- (current)THE JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS
-- (current)The Japanese Society for Genome Editing
Honors & Awards
2021-09第10回 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)Poster Award
2020-09第9回 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)Poster Award
2014-0915th International Conference on Systems Biology Student Bursary Award
Articles
Conference, etc.
  • k-mer profile analysis clarifies cell-type specific TF binding landscape in human
    Saeko Tahara; Takaho Tsuchiya; Haruka Ozaki
    2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)/2021-09-29--2021-09-29
  • CCPLS reveals cell-type specific spatial dependence of transcriptome in single cells
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    CREST BioDX Symposium 2021/2021-11-21--2021-11-22
  • Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cells
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会(IBMP2021)
  • k-mer profile analysis clarifies cell-type specific TF binding landscape in human
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会(IBMP2021)/2021-09-27--2021-09-29
  • ChIP-Atlasの二次解析による多彩な転写因子認識配列の解明および更なるデータベース化
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    トーゴーの日 シンポジウム 2020/2020-10-06--2020-10-06
  • 機械学習を用いたRNA安定性予測モデルの開発
    服部 恵美; 土屋 貴穂; 脇田 寛泰; 川田 健太郎; 山地 雄大; 和田 洋一郎; 秋光 信佳; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • CellCellTopic: cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling
    土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • Large-scale analysis of ChIP-seq database “reveals cell type specific TF binding k-mer
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)/2020-09-01--2020-09-03
  • Large-scale analysis of ChIP-seq database reveals cell type specific TF binding k-mer
    田原 沙絵子; 土屋 貴穂; 尾崎 遼
    生命情報科学若手の会 第12回 研究会/2020-08-27--2020-08-28
  • System Identification of Signaling Dependent Gene Expression with Different Time-Scale Data
    土屋 貴穂
    Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Seminar Series of Cell Fate Dynamics & Therapeutics/2020-03-23
  • シングルセル空間トランスクリプトームデータを用いた遺伝子制御ネットワークの空間分布解析
    土屋 貴穂; 尾崎遼
    第8回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2019)/2019-09-09--2019-09-11
  • 医薬学で応用問題を解くためのバイオインフォマティクス
    土屋 貴穂
    筑波大学 医学医療系 生命医科学域平成30年度公開講演会/2019-02-18
  • 創薬研究におけるデータサイエンス
    土屋 貴穂; 和田 卓也
    特定非営利活動法人 医学統計研究会 特定主題シンポジウム2018 「製薬企業におけるデータ・サイエンティストの役割」/2018-02-03
  • Time-Series Data-Driven Modeling approach for Temporal Decoding of Cellular Signal Transduction in differentiation of PC12 cells
    Tsuchiya Takaho; Kudo Takamasa; Uda Shinsuke; Wada Takum...
    ICSB 2014 - 15th International Conference on Systems Biology/2014-09-14--2014-09-18
Teaching
2021-07 -- 2021-08BioinfomaticsUniversity of Tsukuba.
Other educational activities
2019-07 -- 2019-092019年度 第1-2回 人工知能スキル研修(7月・9月)
Other activities
2012 -- 20162012年度 - 2016年度 東京大学 理学部 生物化学実験I プログラミングパート ティーチングアシスタント
2020-04 -- (current)ヒューマニクス学位プログラム 授業担当教員

(Last updated: 2022-04-12)